求助，请教plumed中WT Metadynamics参数设置

JCenter

zhao-hc20 发表于 2025-2-26 02:27
个人粗见：Barducci提出wt metad的原文中提到了temp这个参数可以取不同的值进行反复模拟，temp不代表体系 ...

“temp（乘以玻尔兹曼常数后）相对于能垒越大则平滑效果越不明显”,这句话是怎么推出来的哇。

Assiduitas

JCenter 发表于 2025-5-19 00:54
大佬，cp2k中metadynamics计算自由能（FPMD）的模块中，使用well-tempered方法时，使用的参数是DELTA_T,p ...

同学，想请问一下：在设置时怎么将一般的metadynamic设置为well-tempered metadynamic方法呢？
PS：最近正在学习怎么进行增强采样，以前一直只用CP2K进行普通的AIMD。目前只是浏览完CP2K的官方手册的例子，正打算将其重现一遍。但其也只是普通的metadynamic。

JCenter

丁越 发表于 2024-1-17 22:43
1. 对于经典动力学模拟来说那么选择峰宽可以，即采用无偏采样后CVs的标准差来确定。但是这个量级对于AIMD模 ...

这里的aimd的峰宽应该是指极差的几分之一吧，按照大球定理，有限数据的极差的几分之一约为完备充分数据的标准差。