计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 1356|回复 Reply: 8
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[建模与可视化] 求助:用VASP结构优化后,用MS和vesta打开CONTCAR 的结构不一样

[复制链接 Copy URL]

5

帖子

0

威望

65

eV
积分
70

Level 2 能力者

求助:一个r=120度的晶体,优化后,用vesta 打开r=120度左右,但是用MS打开就变成了90度。请问这是什么原因造成的?






43

帖子

0

威望

1007

eV
积分
1050

Level 4 (黑子)

2#
发表于 Post on 2024-1-20 15:29:19 | 只看该作者 Only view this author
用VESTA查看好点,你可以用VESTA保存成cif后,再用MS打开就行。

92

帖子

1

威望

817

eV
积分
929

Level 4 (黑子)

3#
发表于 Post on 2024-1-20 16:07:06 | 只看该作者 Only view this author
可能是对称性问题。你可以用M$找一下对称性。

5

帖子

0

威望

65

eV
积分
70

Level 2 能力者

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-1-20 17:33:20 | 只看该作者 Only view this author
John_Tao 发表于 2024-1-20 15:29
用VESTA查看好点,你可以用VESTA保存成cif后,再用MS打开就行。

就是上面的那个MS的cif是用上面vesta转化的

5

帖子

0

威望

65

eV
积分
70

Level 2 能力者

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-1-20 17:34:17 | 只看该作者 Only view this author
logzzz 发表于 2024-1-20 16:07
可能是对称性问题。你可以用M$找一下对称性。

这个有试过,找了那个图更奇怪

43

帖子

0

威望

1007

eV
积分
1050

Level 4 (黑子)

6#
发表于 Post on 2024-1-21 15:17:49 | 只看该作者 Only view this author
那你可以直接用pos2cif脚本转一下成cif格式

1060

帖子

0

威望

3260

eV
积分
4320

Level 6 (一方通行)

7#
发表于 Post on 2024-1-21 17:44:14 | 只看该作者 Only view this author
请仔细看看红圈里的 C 环,已经都不是苯环的正六边形的形状了。可能是你转化的时候没有导入对称性?结果导致结构变形了。


5

帖子

0

威望

65

eV
积分
70

Level 2 能力者

8#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-1-23 22:27:14 | 只看该作者 Only view this author
乐平 发表于 2024-1-21 17:44
请仔细看看红圈里的 C 环,已经都不是苯环的正六边形的形状了。可能是你转化的时候没有导入对称性?结果导 ...

好的,我再看看,谢谢

5

帖子

0

威望

65

eV
积分
70

Level 2 能力者

9#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-1-23 22:28:13 | 只看该作者 Only view this author
John_Tao 发表于 2024-1-21 15:17
那你可以直接用pos2cif脚本转一下成cif格式

好勒,我去试试,感谢赐教

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-25 06:44 , Processed in 0.164179 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list