gaussian如何模拟乙醇溶剂的氢键作用

2877321934 · 发表于 Post on 2024-4-16 10:53:17

我是量化小白，之前用的最多的溶剂模型是pcm，这次遇到一个体系，其乙醇溶剂中的氢键对反应的作用很明显，求教如何使用能模拟其氢键作用的溶剂模型

mt13 · 发表于 Post on 2024-4-16 11:28:34

pcm、smd这些隐式溶剂模型无法表现氢键。需要引入合适数量的显式乙醇分子，至少先猜测可能的氢键构型然后去opt

sobereva · 发表于 Post on 2024-4-16 14:52:08

这叫显式溶剂模型，把参与反应的乙醇直接画出来，作为反应物之一，并且通常同时结合隐式溶剂模型使用，这称为杂化溶剂模型

2877321934 · 发表于 Post on 2024-4-16 15:02:04

sobereva 发表于 2024-4-16 14:52
这叫显式溶剂模型，把参与反应的乙醇直接画出来，作为反应物之一，并且通常同时结合隐式溶剂模型使用，这称 ...

好的感谢老师还有请问可以参考您的文章http://sobereva.com/406来构建模型吗

sobereva · 发表于 Post on 2024-4-17 04:27:11

2877321934 发表于 2024-4-16 15:02
好的感谢老师还有请问可以参考您的文章http://sobereva.com/406来构建模型吗

那篇文章主要是讲构造一个溶质被溶剂包裹的环境的，溶剂仅仅起到环境作用。但你当前的情况是溶剂参与了反应，得考虑怎么摆显式溶剂能让它参与到反应过程中，所以情况并不十分相同。

2877321934 · 发表于 Post on 2024-4-17 11:16:23

sobereva 发表于 2024-4-17 04:27
那篇文章主要是讲构造一个溶质被溶剂包裹的环境的，溶剂仅仅起到环境作用。但你当前的情况是溶剂参与了反 ...

好的感谢老师

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[新手求助] gaussian如何模拟乙醇溶剂的氢键作用