计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 443|回复 Reply: 2
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[新手求助] 求助:在进行构型搜索后,出现断键的情况怎么解决

[复制链接 Copy URL]

1

帖子

0

威望

9

eV
积分
10

Level 1 能力者

硫酸和水进行构型搜索,之后出现这种情况

202406200905183001..png (35.33 KB, 下载次数 Times of downloads: 8)

202406200905183001..png

1060

帖子

0

威望

3256

eV
积分
4316

Level 6 (一方通行)

2#
发表于 Post on 2024-6-20 14:19:18 | 只看该作者 Only view this author
图形显示软件(GaussView,或者 VMD 等等)显示的都不是真实的 “化学键”,只不过是连接方式而已。不要把看到的连线当化学键,也不要没看到连线就认为没有化学键。

说得更极端一些,化学键本来就不是实实在在的物质。世界上根本就没有化学键,只不过是化学家为了形象解释原子之间的关联定义出来的概念而已。本质上是原子间的距离。在某个距离范围内,某些原子的相互作用很强,好像被绑在一起,就是所谓的“化学键”。

图形显示软件(GaussView,或者 VMD 等等)也是类似地原理,如果某两个原子在某个范围内,就显示它们成键,否则就不显示连线。如果在更短的距离,就显示成“双键”,如果比双键的距离更短,就显示成“三键”。仅此而已。所以,只是显示而已,并不是真正的化学键。

所以,不要看连线,也不要在意那些短线。更应该关注原子间的距离。

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112356

管理员

公社社长

3#
发表于 Post on 2024-6-21 06:11:01 | 只看该作者 Only view this author
老生常谈的问题
谈谈原子间是否成键的判断问题
http://sobereva.com/414http://bbs.keinsci.com/thread-9840-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-24 10:30 , Processed in 0.285651 second(s), 30 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list