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[Gaussian/gview] 关于在Gaussian中使用nosymm关键词后体系朝向仍然发生变化

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各位小哥哥,各位大佬们,我最近又遇到了一个奇怪的问题,想请教一下大家呀~
是这样的,最近我想做过渡态+电场方面的计算,然后我在没有电场时,读取.fchk文件,进行偶极矩方向的确认,如图1所示的那样(并且也通过输出的.log文件得到了确认):
Dipole moment (field-independent basis, Debye):
    X=             -1.6635    Y=              1.4643    Z=             -2.3394  Tot=              3.2225

然后呢~为了保险起见,我使用如下关键词,读取这个.fchk对应的chk文件进行了又一遍的计算:
%oldchk=La-1H2O-TS.chk
%nprocshared=64
%mem=60GB
%chk=TS0
# opt=(ts, calcfc, noeigen) freq b3lyp/def2tzvp empiricaldispersion=gd3bj pop=(full,nbo) nosymm geom=allcheck guess=read field=read

0.0000 0.0000 0.0000

计算得到过渡态结构后,诡异的事情发生了!!!得到其偶极矩变为:
(1.3289,-1.1805,-2.6911)和3.2251 Debye。Gaussian它居然又把结构旋转了!!!虽然偶极矩的大小没有明显变化,但X、Y的方向居然反向了!!!为什么鸭?明明我都已经用了“nosymm”关键词了~nosymm怎么在这里突然失效了?到底是哪里出了问题鸭?



真是让我感到好困惑呀~
希望大家能够不吝赐教啊!谢谢大家~

Snipaste_2024-06-30_22-57-25.png (45.66 KB, 下载次数 Times of downloads: 5)

图1.

图1.

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图2.

图2.

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发表于 Post on 2024-7-1 18:21:22 | 只看该作者 Only view this author
直接把坐标写在输入文件里,此时用了nosymm就绝对不可能有坐标整体的变化
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2024-9-10 16:24:03 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-7-1 18:21
直接把坐标写在输入文件里,此时用了nosymm就绝对不可能有坐标整体的变化

您好,老师。我没理解您说的意思,按我的理解输入文件中(.gjf)不就是有包含原子的坐标了吗? 您说的“直接把坐标写在输入文件”是什么意思?该如何操作?
目前还是小白,如果问的比较脑瘫请不吝赐教

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发表于 Post on 2024-9-10 22:55:07 | 只看该作者 Only view this author
王OldMan 发表于 2024-9-10 16:24
您好,老师。我没理解您说的意思,按我的理解输入文件中(.gjf)不就是有包含原子的坐标了吗? 您说的“直 ...

楼主用了geom=allcheck,输入文件里没原子坐标
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2024-9-11 09:32:49 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-9-10 22:55
楼主用了geom=allcheck,输入文件里没原子坐标

好的,谢谢老师。我遇到的问题是:我先用关键词(# opt freq b3lyp/6-31g(d) em=gd3bj nosymm field=z-40)对分子结构进行优化,后面我再用关键词(# m062x/def2TZVP field=z-40 int=ultrafine)计算结构优化后分子的单点能。计算单点能后发现,分子的坐标发生了翻转(即各原子的坐标关于x-y平面发生翻转),通过查计算单点能的输出文件,发现分子的(Standard orientation)坐标发生了变化。请问老师坐标变化的问题该如何解决?是否计算分子在电场条件下的单点能时也应加上关键词(nosymm)?

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发表于 Post on 2024-9-11 11:44:37 | 只看该作者 Only view this author
王OldMan 发表于 2024-9-11 09:32
好的,谢谢老师。我遇到的问题是:我先用关键词(# opt freq b3lyp/6-31g(d) em=gd3bj nosymm field=z-40 ...

nosymm
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发表于 Post on 2024-9-11 15:10:06 | 只看该作者 Only view this author

感谢sob老师

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