计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 101|回复 Reply: 2
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[其它程序] 求助做AIMD后用VMD计算rdf出错

[复制链接 Copy URL]

3

帖子

0

威望

33

eV
积分
36

Level 2 能力者

老师您好,我在做第一性原子分子动力学(AIMD)之后想用VMD进行分析径向分布函数(RDF),在使用VMD时收到了这样的错误提示,我想请问您这是什么原因,该如何解决呢,谢谢老师!我这个体系存在三种原子Ti、H的同位素原子T、还有He。其中He的含量较少,或者是不是与同位素有关,请各位老师指点。


83

帖子

0

威望

527

eV
积分
610

Level 4 (黑子)

傻傻的木瓜

2#
发表于 Post on yesterday 23:12 | 只看该作者 Only view this author
标题应该具体到提问内容哦

只写个Ti不够,请看社长博文《VMD里原子选择语句的语法和例子》
http://sobereva.com/504http://bbs.keinsci.com/thread-14267-1-1.html

另外注意VMD里这个RDF计算插件还是有点局限性的,若是要用于非正交盒子或者需要更好的结果可以考虑下GROMACS的gmx rdf功能。
√546=23.36664289109

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112544

管理员

公社社长

3#
发表于 Post on 5 hour ago | 只看该作者 Only view this author
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问,并清楚、准确反映出帖子具体内容,避免有任何歧义和含糊性,仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题 “第一性原理AIMD后处理软件VMD” 改了,以后务必注意!下次将删帖+扣分处理。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-27 19:54 , Processed in 0.173214 second(s), 24 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list