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[CP2K] 带缺陷的表面溶剂化能计算

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这里想计算的一个任务是在LiF的表面上抠出一个Li原子,让表面变成一个带中性的缺陷表面,然后在表面上方放一个Li原子还有四个溶剂分子,一个平衡离子。通过增强采样或者伞形采样,slow-growth的办法来计算desolvation energy. 这里面主要涉及三步,主要是通过cp2k来计算的。
1)构建不带电的Li空位的表面结构,设置的电荷和自旋都是0 2,结果发现未抠除的体系electrons电子数为750,抠除掉为Spin 1: Number of electrons:                                                        359, Spin2 : Spin 2

Number of electrons:                                                        358。这个感觉跟直觉是相反的,因为抠掉Li原子后电子数按道理来说会变少,另外带缺陷的表面优化也一直不收敛。用的泛函和基组是      ELEMENT Li
      BASIS_SET DZVP-MOLOPT-SR-GTH-q3
      POTENTIAL GTH-PBE

2)在之前计算的过程中,会存在一个问题,就是在这个构建的表面放上一个Li原子和四个溶剂分子。在优化或者跑metadynamics的时候Li原子很容易就掉下来了。老师认为这个地方应该有个很大的势垒才可以。用了cp2k和vasp做了同样的aimd过程,发现都会掉下来。但掉下来速度不一样,cp2k大概是在300-500fs,而vasp则是在大概2000fs。提交文件在附件。想问下这个过程是合理的吗,还是设置错了某些东西。
3)最后的问题是如果我想要在计算准确的话,应该加一个抗衡离子,如图所示,这样我的表面是电中性的带一个Li缺陷的LiF表面,上面是Li离子和四个溶剂分子,以及一个抗衡离子SF6,这样就设置体系的电荷为0。想问下这个设置办法可以用来计算Li离子去溶剂化过程吗,万分感谢。

202504122051563432..png (121.13 KB, 下载次数 Times of downloads: 2)

第三步对应的体系,加了平衡离子的体系。

第三步对应的体系,加了平衡离子的体系。

屏幕截图 2025-04-12 202620.png (176.39 KB, 下载次数 Times of downloads: 2)

屏幕截图 2025-04-12 202620.png

屏幕截图 2025-04-12 204235.png (105.84 KB, 下载次数 Times of downloads: 2)

屏幕截图 2025-04-12 204235.png

aimd.inp

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第二步的aimd提交文件

opt.inp

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第一步对应的LiF表面优化

vac_opt.inp

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第一步对应的含缺陷的LiF表面优化

INCAR

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第二步aimd对应的vaspINCAR文件

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发表于 Post on 2025-4-12 21:20:06 | 只看该作者 Only view this author
3)确定抗衡离子完全不会进入溶剂化结构吗

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发表于 Post on 2025-4-13 23:25:20 | 只看该作者 Only view this author
扣除后是359+358=717<750电子数就是应该变少没错欸。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-4-14 09:16:53 | 只看该作者 Only view this author
gyp 发表于 2025-4-12 21:20
3)确定抗衡离子完全不会进入溶剂化结构吗

不确定,我是想用metadynamics来跑,所以预估是不变。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-4-14 09:21:24 | 只看该作者 Only view this author

嗯,你说的是对的,未抠除是720个电子,抠除掉是717个电子。问题主要是这个中性缺陷的结构不收敛。

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发表于 Post on 2025-4-14 09:24:10 | 只看该作者 Only view this author
maoxinxina 发表于 2025-4-14 09:21
嗯,你说的是对的,未抠除是720个电子,抠除掉是717个电子。问题主要是这个中性缺陷的结构不收敛。

CP2K中遇到SCF难收敛时的解决方法

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