volmap计算溶质分子周围溶剂分子的SDF异常求助

raku · 发表于 Post on 2025-5-12 16:20:59

XIANGCAI 发表于 2025-4-15 12:56
哦哦，确实是因为没选对

您好可以请教下selection应该怎么写嘛，我的体系100个A分子，900个 B 分子，编号从第1号A分子开始，1-100，B分子从101 - 1000. 想要计算编号为50 的A分子周围B分子的分布，请教下该咋写

XIANGCAI · 发表于 Post on 2025-5-13 16:50:13

raku 发表于 2025-5-12 16:20
您好可以请教下selection应该怎么写嘛，我的体系100个A分子，900个 B 分子，编号从第1号A分子开始，1-10 ...

按照你这个的话，应该是在盒子中心只放一个分子A，B分子按比例来。命令应该是not index +A分子的编号

raku · 发表于 Post on 2025-5-14 13:32:04

XIANGCAI 发表于 2025-5-13 16:50
按照你这个的话，应该是在盒子中心只放一个分子A，B分子按比例来。命令应该是not index +A分子的编号

好的好的，我试试，谢谢啦

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[VMD] volmap计算溶质分子周围溶剂分子的SDF异常求助