计算化学专业博士转中药方向求助

小蒜泥

       各位大佬们，本人30岁，硕博研究方向均为酶催化反应的理论计算研究，纯计算方向，主要方法包括分子动力学模拟、QM/MM计算等，目前我刚入职某中医药研究院几个月，发现中药研究和我之前的研究方向还是有比较大的壁垒，我们科室现在主要是做药理研究，但是能用到的计算内容很少。我现在非常迷茫，不知道该往哪个方向发展，或者是药学相关的都可以，我想到的一个是和实验合作或者自学，做一些天然产物的生物合成研究，加上我之前做的酶的相关计算，但是担心实验部分会不会难度太大，我读研一直做的是干实验，不知道这一块怎么样，另外我想的是AI+药物设计，但是AI这方面我基础也比较薄弱，在想要不要去读个博后，所以不知道以后走哪个方向比较好，或者还有没有其他好的选择，恳请大佬们给迷茫中的小白指点迷津，万分感谢！！

WOOOOWOOOO

大佬好，我是一名在读研究生，提供我的想法供您参考。各行各业AI现在是纯蹭的。因为每一层级都要相应要求，所以一个项目有AI等文件中有的热词就比较好过，说白了就是风口。风口过了呢？下一任不提了呢，不可能永远在找方向的路上。

dzdhp

我是中药方向的，硕士阶段自学的模拟和量化，也去过几次sob老师的课，现在还在中药组做计算，偶尔也搞实验，刚好跟你相反。说说我的看法，你去错地方了。药理主搞动物，跟计算关系很牵强，我看到过有加计算的，但是篇幅极小。中药方向我做的最多的计算就是药剂方向，动力学和量化都能用上，什么凝胶、低共熔物/离子液体，还有透皮递送。要么就是蛋白相关的，比如陈士林院士还有屠鹏飞老师他们组，搞中药和蛋白，这一块计算也能派上用场。生物合成我们组也有人做，说实话跟计算关系也有点牵强，感觉都在搞通路解析，计算也插不进去。个人认为中药跟计算最相关的的就是制剂+递送，或者蛋白。AI口的陈院士组有一个陈伟老师，就是搞这个的，你可以去看看人家做的内容，也是一个不怎么了解实验的老师。这块有点难评，中药+al我认为全是忽悠，自己有几个活性成分都没搞清楚，就照着化药+ai套，不可否认也有人搞出了很有价值的成果，但是对于初学者我觉得还是要掂量一下。还有最诚恳的建议，不要跟人合作！不要跟人合作！不然你永远都只能是共一第二或者二三四五六作，搞实验的永远都只会把你当工具人使。除非是你自己设计的课题，或者你能搞到通讯。如果你想搞博后，要么去那种干湿结合的组，要么去只有你一个人搞计算但是给你分研究生干活的组。方向的选择确实困难，保不准就掉大坑了。希望我这点经验对你有帮助。

glycosylation

天然产物合成难道不是大坑吗……（生物合成的话还得学蛋白质定向进化？）

药理方向的实验室，可以自由选择发展方向的话，要是我是你的话应该会选择做中药分子和靶点的docking……实验部分就直接找同事，有点结果的那种，选他们课题的小分子药物和靶蛋白做底物进行分子动力学模拟。

因为刚入职以后若干年内应该也是会有考核的吧？要是直接上手自己完全不熟悉的方向岂不是考核都很难过掉？更何况还是全合成这种深坑……

楼上说的作者顺位确实是个问题，看你们单位是不是要求一作才能晋升啥的了。要是没有强制一作或者大通讯，可以靠数量取胜的话合作也行，因为计算作为一小块的话不用费太大心思但是文章的数量可以很多。（比如我们单位和外单位合作的话算奖金的时候算30%这样，那我帮算4个课题就有120%了相当于）

另外如果有编制了的话真不建议再去读博后……编制的坑可是一年比一年难进的。

以上个人建议，仅供参考。

小蒜泥

WOOOOWOOOO 发表于 2025-5-21 09:12
大佬好，我是一名在读研究生，提供我的想法供您参考。各行各业AI现在是纯蹭的。因为每一层级都要相应要求， ...

谢谢！您的观点我非常赞同！