计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 113|回复 Reply: 2
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[GROMACS] 求助:预编译GROMACS对四点水模型使用-update gpu报错

[复制链接 Copy URL]

25

帖子

0

威望

254

eV
积分
279

Level 3 能力者

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
本帖最后由 KazusaT 于 2025-7-26 14:47 编辑

今天在使用AMBER19SB力场配套OPC水模型模拟小肽折叠-聚集过程时发现运算速度比之前慢很多,查看发现update被放到cpu了,于是添加-update gpu结果报错:
Inconsistency in user input:
Update task can not run on the GPU, because the following condition(s) were
not satisfied:
  Virtual sites are not supported.


使用的是刚编译好的Windows版GROMACS 2025.2这里的GROMACS 2025.2 Windows预编译版本,随后在Ubuntu下我自己编译的GROMACS 2025.2下则可以正常-update gpu,速度没有异常,请问有人遇到相似的问题吗?这是预编译的普遍问题还是该预编译版本的问题?


【更新】Linux版本也不可以,是我测试时用了错误的文件误以为可以,应该是目前GROMACS还不支持使用OPC水模型时GPU加速PP update

86

帖子

3

威望

1747

eV
积分
1893

Level 5 (御坂)

2#
发表于 Post on 2025-7-26 14:38:14 | 只看该作者 Only view this author
Linux下的GROMACS应该也不能对OPC水update gpu呀,虚拟位点不支持update gpu

25

帖子

0

威望

254

eV
积分
279

Level 3 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-7-26 14:48:19 | 只看该作者 Only view this author
Dempey 发表于 2025-7-26 14:38
Linux下的GROMACS应该也不能对OPC水update gpu呀,虚拟位点不支持update gpu

是的是的,我刚刚查看输出文件时发现是我用了错误的文件,是不支持的,已经在帖子中更新

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2025-8-12 20:00 , Processed in 0.140600 second(s), 20 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list