VMD进行RDG分析问题

xzxueren · 发表于 Post on 2017-4-28 09:48:58

重做系统后，重新安装VMD，做NCI分析，得到的RDG等值面图（图1）和之前做的图（图2）间区别怎么这么大？cub文件相同，是vmd参数设置问题？似乎也没啥变化啊，不解。

参数设置如下：
mol new func1.cub
mol addfile func2.cub
mol delrep 0 top
mol representation CPK 0.6 0.3 18.0 16.0
mol addrep top
mol representation Isosurface 0.50000 1 0 0 1 1
mol color Volume 0
mol addrep top
mol scaleminmax top 1 -0.04 0.02
color scale method BGR
color Display Background white

ssp2493187 · 发表于 Post on 2017-4-28 16:24:31

我没看出来问题在哪儿，但是给个建议吧，换个电脑用VMD重新做一下图看结果是不是一样的

teller3531 · 发表于 Post on 2017-4-28 16:30:52

把分子内的屏蔽掉会好看点

sobereva · 发表于 Post on 2017-4-30 10:49:53

肯定是和你当时作图用的RDG的isovalue值不一样，在VMD里调整isovalue值使得图像和原先相同即可

xzxueren · 发表于 Post on 2017-4-30 20:01:09

多谢各位指教，我再试试

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