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[波函数分析求助] 请教COF片段结合氧气的电荷密度差计算问题

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各位老师好,看到sob老师博文(http://sobereva.com/113),用Gaussian结合Multiwfn绘制电荷密度差也可以,我像计算COF片段结合氧气的电荷密度差如下图,想请问(1)这个转移数值如何定量分析?(2)O2在优化过程是会移动的,能否直接用吸附后的减去氧气和COF片段?还是说应该用COF+O2优化后的片段去掉COF得到的氧气位置优化,然后使用这个氧气做分析?

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发表于 Post on 7 day ago | 只看该作者 Only view this author
严格按照博文内的流程进行操作!

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3#
发表于 Post on 6 day ago | 只看该作者 Only view this author
算O2或者COF的片段电荷,自然知道转移了多少
片段电荷等于片段内原子电荷的加和,看下文了解原子电荷的常识
一篇深入浅出、完整全面介绍原子电荷的综述文章已发表!
http://sobereva.com/714http://bbs.keinsci.com/thread-46067-1-1.html
《原子电荷计算方法的对比》(https://doi.org/10.3866/PKU.WHXB2012281
不同几何结构下O2的片段电荷都不同,显然应该用优化完的对应吸附状态的极小点结构计算才有意义

亦可以绘制下文的图进行直观分析
使用CP2K结合Multiwfn绘制密度差图、平面平均密度差曲线和电荷位移曲线
http://sobereva.com/638http://bbs.keinsci.com/thread-28225-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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开心小鲨鱼 ORCA的饲养员/夜宵

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发表于 Post on 6 day ago | 只看该作者 Only view this author
用COF+O2优化后的片段,基于这个结构的所有原子坐标,建立第一个文件保留COF坐标,第二个保留氧气坐标。分别算单点能。这样做得到密度差

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 楼主 Author| 发表于 Post on 5 day ago | 只看该作者 Only view this author
明白了,感谢sob和SharkYYX2025二位老师的指导

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