过渡态虚频只有负几十是否能当作反应可能过渡态？

冰镇小恐龙 · 发表于 Post on 前天 16:48

本帖最后由冰镇小恐龙于 2026-7-24 16:48 编辑

尊敬的各位老师亲爱的同学大家好。想向大家请教一下这个问题
我简单描述一下具体情况，详细的情况在文件里,文末有一个File的压缩包。
int3+和int4是我想连接的产物与反应物，我便对他们做了一个二面角扫描，扫描时针对最高点opt（ts,calcall,nogeigen）
旋即得到此过渡态，虚频仅为-38.我本意想通过IRC验证过渡态是否链接两段产物，但是由于虚频太高导致IRC提前终止了。这种情况下我可以把这个低虚频过渡态当成反应真是过渡态么？鄙人不才线性谢过各位了（抱拳）

sgwzq · 发表于 Post on 前天 20:16

应该看一下虚频对应振动模式的动画，如果动画正对应你的反应物和产物，那这个TS就是你要找的过渡态。
另外，一般SN2或者E2的过渡态，虚频应该是几百cm-1多才对。几十cm-1的大概率有问题。

Rowena · 发表于 Post on 前天 21:31

重点是C-S距离，扫二面角干什么，看了下文件应该是找错了

冰镇小恐龙 · 发表于 Post on 前天 21:42

sgwzq 发表于 2026-7-24 20:16
应该看一下虚频对应振动模式的动画，如果动画正对应你的反应物和产物，那这个TS就是你要找的过渡态。
另外 ...

老师您好，那我有一个问题，如果震动动画对应的就是反应物和产物的情况下，波数还是很大只有负几十的情况会存在么？如果存在会是因为什么？

HamsterXiao · 发表于 Post on 前天 22:05

冰镇小恐龙发表于 2026-7-24 21:42
老师您好，那我有一个问题，如果震动动画对应的就是反应物和产物的情况下，波数还是很大只有负几十的情况 ...

小虚频可能对应构象过渡态，不涉及共价键的形成和断裂，更保险的确定过渡态的做法还是确定能跑出完整的irc连接反应物和产物

sgwzq · 发表于 Post on 前天 23:32

冰镇小恐龙发表于 2026-7-24 21:42
老师您好，那我有一个问题，如果震动动画对应的就是反应物和产物的情况下，波数还是很大只有负几十的情况 ...

振动模式正确一般就没太大问题。IRC不追求完整跑到反应物和产物，只需要跑几步看出反应趋势即可。如果你的振动模式正确，波数小也问题不大。

火星哥 · 发表于 Post on yesterday 09:36

首先看受否收敛，然后看振动的构象是否正确，最后作IRC验证，前几天我算出来一个-27的过渡态虚频，最后IRC是正确的。

sobereva · 发表于 Post on yesterday 10:54

永远不要光凭虚频大小进行判断

至少做振动分析看虚频模式，还不能判断就跑IRC，IRC中途自动停的问题下文明确说了怎么解决
在Gaussian中计算IRC的方法和常见问题
http://sobereva.com/400（http://bbs.keinsci.com/thread-7736-1-1.html）

Dave666 · 发表于 Post on yesterday 16:01

我有几个插入反应，过渡态是三元环，虚频就是几十

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register

[新手求助] 过渡态虚频只有负几十是否能当作反应可能过渡态？

评分 Rate