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楼主 Author: sobereva
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[Multiwfn资源与经验] 详谈Multiwfn支持的输入文件类型、产生方法以及相互转换

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-8-8 04:41:36 | 只看该作者 Only view this author
今日在官网上更新的Multiwfn已经支持载入.gro格式(常用于GROMACS程序中),并对此文进行了更新
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-6-6 12:25:20 | 只看该作者 Only view this author
今日更新的Multiwfn已能够支持ORCA和Dalton产生的带h基函数的.molden文件
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-6-18 04:24:53 | 只看该作者 Only view this author
今日更新的Multiwfn新支持了载入VASP格点数据文件,新增加了以下内容

Multiwfn支持载入VASP的POSCAR、CHGCAR/CHG、ELFCAR、LOCPOT文件。POSCAR可以给Multiwfn提供坐标、晶胞信息,CHGCAR/CHG、ELFCAR、LOCPOT还可以额外分别提供VASP计算产生的电子密度、ELF、单电子感受到的外势信息。文件名必须包含格式名,例如如果以CHGCAR格式载入,那么输入文件可以以诸如nozomi.CHGCAR、CHGCAR-maki为名。对于自旋极化计算,CHGCAR/CHG同时包含总密度和自旋密度、ELFCAR会记录对alpha和beta电子分别计算的ELF、LOCPOT会记录alpha和beta电子分别感受到的外势,Multiwfn在载入时会问你载入哪个。值得一提的是,在产生LOCPOT时,若LVHAR=.TRUE,则LOCPOT里记录的相当于静电势的负值,Multiwfn在载入时会问你是否反转符号,如果选y的话则载入的就相当于静电势;如果LVHAR=.FALSE.,则LOCPOT里记录的相当于静电势的负值+交换相关势。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-9-29 08:50:54 | 只看该作者 Only view this author
今日更新的Multiwfn已经可以通过主功能100的子功能2产生VASP的POSCAR文件了
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发表于 Post on 2022-4-17 22:58:22 | 只看该作者 Only view this author
用Gaussian产生wfn文件时,Linux系统是否必须写绝对路径?

我写的相对路径,能够产生wfn文件,但是程序最后报错,提示Blank file name read.

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-4-18 02:01:04 | 只看该作者 Only view this author
mfdsrax2 发表于 2022-4-17 22:58
用Gaussian产生wfn文件时,Linux系统是否必须写绝对路径?

我写的相对路径,能够产生wfn文件,但是程序 ...

非必须

格式不对
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发表于 Post on 2022-4-18 12:44:19 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-4-18 02:01
非必须

格式不对

我上传了输入输出文件,麻烦帮我看看问题在哪里

a.rar

105.77 KB, 下载次数 Times of downloads: 2

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发表于 Post on 2022-4-18 13:13:21 | 只看该作者 Only view this author
mfdsrax2 发表于 2022-4-18 12:44
我上传了输入输出文件,麻烦帮我看看问题在哪里

文件最后少个空行。

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发表于 Post on 2022-4-18 15:42:43 | 只看该作者 Only view this author
snljty 发表于 2022-4-18 13:13
文件最后少个空行。

看这个附件,我加了空行,还是一样的问题

b.rar

102.65 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

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发表于 Post on 2022-4-18 16:43:56 | 只看该作者 Only view this author
mfdsrax2 发表于 2022-4-18 15:42
看这个附件,我加了空行,还是一样的问题

拿最后一帧做个单点能再输出wfn试下,可以guess=read。顺便现在wfn文件基本没用,你要是交给Multiwfn,用fch就行。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-8-12 06:10:36 | 只看该作者 Only view this author
今天更新的Multiwfn对于周期性体系可以通过主功能100的子功能2导出GROMACS的gro文件了
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-4-24 01:10:33 | 只看该作者 Only view this author
今天更新的Multiwfn已经支持读取Quantum ESPRESSO的输入文件,可以提供原子和晶胞信息。只支持ibrav=0的情况
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发表于 Post on 2025-5-4 10:23:00 | 只看该作者 Only view this author
multiwfn载入cif文件时,对用xyz表达的对称操作(等效原子位置)有什么特殊要求吗?

CP2K培训班讲义有个结构优化实例7,介绍了VESTA操作旋转晶格的技巧,今用3.5.8版VESTA对面心立方Pd晶胞如此操作并导出如下cif文件。
Pd-rotated.cif (4.74 KB, 下载次数 Times of downloads: 2)
试图用最新版multiwfn载入时报错退出:
  1. Please wait...
  2. Loading cell information
  3. Loading information of unique atoms
  4. Number of symmetrically unique atoms:      1
  5. Loading symmetry opteration and replicate atoms
  6. Number of symmetry operations:  96
  7. *** Error in syntax of function string: Missing operator

  8. 1/2x+1/2y+z
  9.     ?
复制代码
√546=23.36664289109

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-5-4 23:30:23 | 只看该作者 Only view this author
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2025-5-4 10:23
multiwfn载入cif文件时,对用xyz表达的对称操作(等效原子位置)有什么特殊要求吗?

CP2K培训班讲义有个 ...

主要原因是诸如1/2x需要写成1/2*x,要不然无法解析公式。还有次要原因。过些天我更新Multiwfn新版本时会修正此问题
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-5-5 02:54:50 | 只看该作者 Only view this author
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2025-5-4 10:23
multiwfn载入cif文件时,对用xyz表达的对称操作(等效原子位置)有什么特殊要求吗?

CP2K培训班讲义有个 ...

我已更新Multiwfn官网上最新版本,能载入了

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Uus/pMeC6H4-/キ + 1 谢谢

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