计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
楼主 Author: 小书童
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[综合讨论] 吸附能计算问题

[复制链接 Copy URL]

407

帖子

0

威望

856

eV
积分
1263

Level 4 (黑子)

16#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-11-28 12:31:47 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 小书童 于 2017-11-28 12:35 编辑
卡开发发 发表于 2017-11-28 10:48
公式我觉得没问题,如果算出来没虚频应该没啥问题,具体有没有问题光看值我看不出有问题。

恩恩,非常感谢您的帮助,您对比过电子能量的吸附能和吉布斯自由能的吸附能的大小关系吗?冒昧的问您下,您在思想家公社群里的QQ名称是?

3809

帖子

3

威望

1万

eV
积分
20343

Level 6 (一方通行)

围观吃瓜群众

17#
发表于 Post on 2017-11-28 13:20:23 | 只看该作者 Only view this author
小书童 发表于 2017-11-28 12:31
恩恩,非常感谢您的帮助,您对比过电子能量的吸附能和吉布斯自由能的吸附能的大小关系吗?冒昧的问您下, ...

我不在群内。

评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +5 收起 理由
Reason
小书童 + 5 谢谢

查看全部评分 View all ratings

日常打哑谜&&探寻更多可能。
原理问题不公开讨论,非商业性质讨论欢迎私聊。不做培*,不接代*,不接*发谢谢。

407

帖子

0

威望

856

eV
积分
1263

Level 4 (黑子)

18#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-11-28 14:39:32 | 只看该作者 Only view this author

恩恩,非常感谢您。此外我测试了下固定部分原子和不固定原子,算出来吸附能差0.02eV,我觉这个0.02eV还算可以接受吧。谢谢老师一路上的指点和帮助!

38

帖子

0

威望

261

eV
积分
299

Level 3 能力者

19#
发表于 Post on 2023-5-16 15:58:00 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 wangyuxiao 于 2023-5-16 16:03 编辑
卡开发发 发表于 2017-11-28 10:48
公式我觉得没问题,如果算出来没虚频应该没啥问题,具体有没有问题光看值我看不出有问题。

老师,想请教您两个问题:1、vasp软件上用ΔG计算吸附能的公式和用电子的基态能量做吸附能(ΔE),ΔG=G(gas+solid)-G(gas)-G(solid)?如果是的话,那么G(gas+solid)、G(gas)和G(solid)做频率计算都要保证没有虚频才可以?

2、如果是分子吸附在表面的自由能校正,优化后去做频率计算,可以全部固定表面的原子去做频率计算吗,是不是也要保证算出来没有虚频?我算出来的有两个虚频,请老师指点一下

38

帖子

0

威望

261

eV
积分
299

Level 3 能力者

20#
发表于 Post on 2023-5-16 16:13:22 | 只看该作者 Only view this author
卡开发发 发表于 2017-11-28 10:48
公式我觉得没问题,如果算出来没虚频应该没啥问题,具体有没有问题光看值我看不出有问题。

老师,请教您两个问题
1、用吉布斯自由能做吸附能ΔG,ΔG=G(gas+solid)-G(gas)-G(solid)?如果这个公式正确的话,那么G(gas+solid)、G(gas)和G(solid)计算频率时,全要保证没有虚频
2、老师如果我计算的是自由能校正,分子吸附在表面的情况,可以全部固定表面的原子吗?优化后计算频率是不是也要保证没有虚频,我计算出来的频率有两个虚频,是结构不稳定吗?参数EDIFF=1E-7,EDIFFG=-0.03。请老师指点一下

9

帖子

0

威望

177

eV
积分
186

Level 3 能力者

21#
发表于 Post on 2023-6-8 10:46:42 | 只看该作者 Only view this author
wangyuxiao 发表于 2023-5-16 15:58
老师,想请教您两个问题:1、vasp软件上用ΔG计算吸附能的公式和用电子的基态能量做吸附能(ΔE),ΔG=G ...

我看很多人计算都是固定表面原子,对吸附的分子算频率。算ZPE时,就实频加起来呗。(刚开始学VASP的新手。)

10

帖子

0

威望

171

eV
积分
181

Level 3 能力者

22#
发表于 Post on 2023-6-30 22:11:27 | 只看该作者 Only view this author
Lilunjisuan 发表于 2023-6-8 10:46
我看很多人计算都是固定表面原子,对吸附的分子算频率。算ZPE时,就实频加起来呗。(刚开始学VASP的新手 ...

您好!我最近也在做相关方面的计算 ,请问您上面的问题解决了嘛?对于气体吸附前后的自由能变,吸附后的构型进行频率分析可以只放开被吸附气体和固体表面的几层原子吗?吸附前的固体进行频率分析要全部放开吗?

10

帖子

0

威望

171

eV
积分
181

Level 3 能力者

23#
发表于 Post on 2023-6-30 22:18:43 | 只看该作者 Only view this author
wangyuxiao 发表于 2023-5-16 16:13
老师,请教您两个问题
1、用吉布斯自由能做吸附能ΔG,ΔG=G(gas+solid)-G(gas)-G(solid)?如果这个公式 ...

您好!我最近也在做相关方面的计算 ,请问您上面的问题解决了嘛?对于气体吸附前后的自由能变,吸附后的构型进行频率分析可以只放开被吸附气体和固体表面的几层原子吗?吸附前的固体进行频率分析要全部放开吗?

38

帖子

0

威望

261

eV
积分
299

Level 3 能力者

24#
发表于 Post on 2023-7-12 08:00:49 | 只看该作者 Only view this author
sjlgaga 发表于 2023-6-30 22:18
您好!我最近也在做相关方面的计算 ,请问您上面的问题解决了嘛?对于气体吸附前后的自由能变,吸附后的 ...

有的大佬说,吸附后的只让吸附的分子放开,然后固体的和吸附之后固体也没有放开就抵消了

38

帖子

0

威望

261

eV
积分
299

Level 3 能力者

25#
发表于 Post on 2023-7-12 08:01:34 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 wangyuxiao 于 2023-7-12 08:02 编辑
wangyuxiao 发表于 2023-7-12 08:00
有的大佬说,吸附后的只让吸附的分子放开,然后固体的和吸附之后固体也没有放开就抵消了


38

帖子

0

威望

261

eV
积分
299

Level 3 能力者

26#
发表于 Post on 2023-7-12 08:03:32 | 只看该作者 Only view this author
sjlgaga 发表于 2023-6-30 22:18
您好!我最近也在做相关方面的计算 ,请问您上面的问题解决了嘛?对于气体吸附前后的自由能变,吸附后的 ...

如果你有其他的方法,我们一块相互学习,蟹蟹噢

9

帖子

0

威望

177

eV
积分
186

Level 3 能力者

27#
发表于 Post on 2023-9-11 22:48:20 | 只看该作者 Only view this author
sjlgaga 发表于 2023-6-30 22:18
您好!我最近也在做相关方面的计算 ,请问您上面的问题解决了嘛?对于气体吸附前后的自由能变,吸附后的 ...

目前计算的析氢反应,只放开H原子,进行频率分析,得到ZPE。吸附前的基底全部放开进行频率计算,主要是看看有没有虚频,判断结构是否稳定。不过七八十个原子,小服务器算起来有点慢

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-21 15:51 , Processed in 0.234348 second(s), 22 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list