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[波函数分析求助] 福井函数计算及在gview中的显示问题求助

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发表于 Post on 2018-8-9 07:20:35 | 只看该作者 Only view this author
1 对。multiwfn手册4.7.3节有明示
2 也得考虑等值面的正负。因为相对活性看的是不同位点上福井函数的大小,相当于福井函数正值部分和负值部分的加和
3 不用写,因为布居数就是电子的个数,没单位,求差还是没单位。但倘若有某些编辑死活非让你写单位,就写a.u.
4 你这体系明适合把福井函数投影到电子密度等值面考察,因为碳原子被包在内部,分子表面的填色不容易体现碳原子上福井函数总量。
我没看出福井函数等值面图和简缩福井函数有任何矛盾之处,都体现氟和碳上都有一定分布。
注意等值面图的图形和你选取的等值面数值有关,一个等值面下并没法把函数在三维空间上的分布全面体现。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-8-9 10:55:37 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-8-9 07:20
1 对。multiwfn手册4.7.3节有明示
2 也得考虑等值面的正负。因为相对活性看的是不同位点上福井函数的大小 ...

      发完之后发现我上传的图片占地这么大,可能是分辨率的关系,不好意思。
      前 3 个问题我了解了,谢谢老师。
      第 4 个问题 您说没发现什么矛盾之处,碳氟上都有分布,  确实是都有分布,看简缩福井函数的话两者之间的差别确实不大,但我是认为F上的覆盖面应该比C上的大,我也选取了多个等值面数值,要么就是覆盖面都增大,看不出差别了,要么就是我上传的这样。按照老师说的那估计是 C 被内包,一个等值面不能完全体现分布。
       您说将福井函数投影到电子密度等值面考察,是不是就是我上传的蓝色的那个电子密度图 ?从我上传的链接中操作步骤上看似乎是这样。   若不是,请教老师在gview里面应该怎样投影

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发表于 Post on 2018-8-10 05:04:52 | 只看该作者 Only view this author
PinkP 发表于 2018-8-9 10:55
发完之后发现我上传的图片占地这么大,可能是分辨率的关系,不好意思。
      前 3 个问题我了解 ...

不是分辨率的事,而是你上传之前没有把图片多余的地方切割掉
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2018-8-10 05:28:11 | 只看该作者 Only view this author
PinkP 发表于 2018-8-9 10:55
发完之后发现我上传的图片占地这么大,可能是分辨率的关系,不好意思。
      前 3 个问题我了解 ...

那不叫“电子密度图 ”,而叫"福井函数投影到电子密度等值面"图,或者“根据福井函数着色的电子等值面图”

简缩福井函数和福井函数等值面图看起来有矛盾,完全是因为单一等值面数值下的等值面图对你有误导性,你正确理解了等值面图的含义就不会觉得有矛盾了
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-8-10 10:18:12 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-8-10 05:28
那不叫“电子密度图 ”,而叫"福井函数投影到电子密度等值面"图,或者“根据福井函数着色的电子等值面图 ...

我知道了。非常感谢老师   

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