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[波函数分析求助] 福井函数计算及在gview中的显示问题求助

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发表于 6 天前 | 显示全部楼层 |阅读模式
各位老师好。我此次求助的问题具体有以下4个,主要是最后一个问题,问题有点多,辛苦老师
1、首先确认一下两组公式,p为电子布局数,q为原子电荷数,那么就有  f+=p(N+1)-p(N)  ,同时 f+=q(N)-q(N+1)   对吗? 这两者刚好相反
2、在等值图中两种不同的颜色代表正、负,那么在比较不同原子间活性时只需要考虑等值图覆盖面大小,跟等值面正负无关  对吗?
3、简缩福井函数值有 单位吗?
4、我用高斯以及Multiwfn得到了c-C4F8的简缩福井函数 以及 电子密度.cub和福井函数 .cub文件,然后将.cub文件在GaussView中绘制填色等值面图(根据http://sobereva.com/402),却发现福井函数等值图的显示结果和计算出的简缩福井函数值 相反(如下图),但我算的另外一种物质就显示正常,所以我想请老师帮我看看这是什么原因,跟C环是否有关系?依次为 f- 的电子密度等值面和福井函数等值面, f+的电子密度等值面和福井函数等值面,电子密度图和计算的简缩福井函数一致,但福井函数等值面就不一致了。

f- 电子密度等值面

f- 电子密度等值面

f- 福井函数等值面

f- 福井函数等值面

f+ 电子密度等值面

f+ 电子密度等值面

f+ 福井函数等值面

f+ 福井函数等值面

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发表于 5 天前 | 显示全部楼层
1 对。multiwfn手册4.7.3节有明示
2 也得考虑等值面的正负。因为相对活性看的是不同位点上福井函数的大小,相当于福井函数正值部分和负值部分的加和
3 不用写,因为布居数就是电子的个数,没单位,求差还是没单位。但倘若有某些编辑死活非让你写单位,就写a.u.
4 你这体系明适合把福井函数投影到电子密度等值面考察,因为碳原子被包在内部,分子表面的填色不容易体现碳原子上福井函数总量。
我没看出福井函数等值面图和简缩福井函数有任何矛盾之处,都体现氟和碳上都有一定分布。
注意等值面图的图形和你选取的等值面数值有关,一个等值面下并没法把函数在三维空间上的分布全面体现。
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 楼主| 发表于 5 天前 | 显示全部楼层
sobereva 发表于 2018-8-9 07:20
1 对。multiwfn手册4.7.3节有明示
2 也得考虑等值面的正负。因为相对活性看的是不同位点上福井函数的大小 ...

      发完之后发现我上传的图片占地这么大,可能是分辨率的关系,不好意思。
      前 3 个问题我了解了,谢谢老师。
      第 4 个问题 您说没发现什么矛盾之处,碳氟上都有分布,  确实是都有分布,看简缩福井函数的话两者之间的差别确实不大,但我是认为F上的覆盖面应该比C上的大,我也选取了多个等值面数值,要么就是覆盖面都增大,看不出差别了,要么就是我上传的这样。按照老师说的那估计是 C 被内包,一个等值面不能完全体现分布。
       您说将福井函数投影到电子密度等值面考察,是不是就是我上传的蓝色的那个电子密度图 ?从我上传的链接中操作步骤上看似乎是这样。   若不是,请教老师在gview里面应该怎样投影

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发表于 4 天前 | 显示全部楼层
PinkP 发表于 2018-8-9 10:55
发完之后发现我上传的图片占地这么大,可能是分辨率的关系,不好意思。
      前 3 个问题我了解 ...

不是分辨率的事,而是你上传之前没有把图片多余的地方切割掉
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发表于 4 天前 | 显示全部楼层
PinkP 发表于 2018-8-9 10:55
发完之后发现我上传的图片占地这么大,可能是分辨率的关系,不好意思。
      前 3 个问题我了解 ...

那不叫“电子密度图 ”,而叫"福井函数投影到电子密度等值面"图,或者“根据福井函数着色的电子等值面图”

简缩福井函数和福井函数等值面图看起来有矛盾,完全是因为单一等值面数值下的等值面图对你有误导性,你正确理解了等值面图的含义就不会觉得有矛盾了
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 楼主| 发表于 4 天前 | 显示全部楼层
sobereva 发表于 2018-8-10 05:28
那不叫“电子密度图 ”,而叫"福井函数投影到电子密度等值面"图,或者“根据福井函数着色的电子等值面图 ...

我知道了。非常感谢老师   
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