求助：使用Tobermorites做晶胞优化时泛函基组的选择

KemingZhu · 发表于 Post on 2024-11-30 01:05:47

本帖最后由 KemingZhu 于 2024-11-30 01:05 编辑

请问各位老师，我是一个小白刚开始入门学习用CP2K做Tobermorites（一种周期性晶体结构，包含元素为Ca, Si, O, H）的结构和晶胞优化，在优化时选择了B3LYP杂化泛函（PBE做初猜），DZVP-MOLOPT-SR-GTH基组以及GTH-PBE赝势。不知这样选取是否合理，还烦请请各位老师指教。
我的目的是使用CP2K计算优化后体系的能量和力然后用于构建一个训练集用于机器学习势的训练，优化后进行单点能计算时候是否需要用到大一点的基组呢？

sobereva · 发表于 Post on 2024-12-2 04:28:55

CUTOFF_RADIUS 2.0这也太离谱了。该扩胞扩胞。
单点需要更大基组
B3LYP算这个哪能不带色散校正
这种体系优化用纯泛函就够了

Uus/pMeC6H4-/キ · 发表于 Post on 2024-12-2 11:17:41

话说训练集具体涉及哪些体系呢，有啥特别理由采用B3LYP这个杂化泛函？我感觉有这样的可能，就算按上面社长说的扩胞（A和B方向都不到8埃，太小）、增大库伦截断半径（看博文http://sobereva.com/690第二节）、加上色散校正以后，还是会存在理论方法选择的疑问。

KemingZhu · 发表于 Post on 2024-12-2 16:33:40

sobereva 发表于 2024-12-2 04:28
CUTOFF_RADIUS 2.0这也太离谱了。该扩胞扩胞。
单点需要更大基组
B3LYP算这个哪能不带色散校正

谢谢sob老师提点！我扩胞之后重新设置一下CUTOFF

KemingZhu · 发表于 Post on 2024-12-2 16:53:43

Uus/pMeC6H4-/キ发表于 2024-12-2 11:17
话说训练集具体涉及哪些体系呢，有啥特别理由采用B3LYP这个杂化泛函？我感觉有这样的可能，就算按上面社长 ...

谢谢老师回复！我的训练集体系就是上述的Tobermorites (9、11、14 Å)，氢氧化钙、硅酸三钙这些由Ca、Si、O、H这些主族元素构成的体系。想用B3LYP是觉得它形式比较简单，在杂化泛函中计算速度较快，相比较于纯泛函可能结果更好。那我按照两位老师建议直接用纯泛函优化体系，谢谢老师。

Uus/pMeC6H4-/キ · 发表于 Post on 2024-12-2 17:36:20

本帖最后由 Uus/pMeC6H4-/キ于 2024-12-15 15:15 编辑

KemingZhu 发表于 2024-12-2 16:53
谢谢老师回复！我的训练集体系就是上述的Tobermorites (9、11、14 Å)，氢氧化钙、硅酸三钙这些由Ca ...

不用叫老师哦{ /) (\ }“B3LYP计算速度快”这种孤立体系量子化学计算的经验不一定能直接照搬到周期性体系第一性原理计算，特别是还考虑到上面链接的社长博文690提到的周期性体系杂化泛函计算的一大堆要点。另外今年的http://sobereva.com/706里前两个投票也能多少体现出这两类任务用的泛函之别。

最好还是调研一下相关体系的文献看看用的什么泛函。（编辑：应实验室要求移除部分内容）

KemingZhu · 发表于 Post on 2024-12-3 08:26:10

Uus/pMeC6H4-/キ发表于 2024-12-2 17:36
不用叫老师哦{ /) (\ }“B3LYP计算速度快”这种孤立体系量子化学计算的经验不一定能直接照搬到周期性体系 ...

好的好的！我再去调研一下，多谢指点

xjtuglr · 发表于 Post on 2024-12-6 11:03:41

楼主您好，我最近也在算这个，目前也有了一部分结构，可否交流一下

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