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[Gaussian/gview] ONIOM提取高层算频率出现虚频的问题的求解

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楼主
在使用oniom进行结构优化之后,提取高层分子单独进行频率计算经常出现虚频。所以根据Gaussian中几何优化收敛后Freq时出现NO或虚频的原因和解决方法,加上了 tight,calcall,int=ultrafine关键词。结构优化部分可以收敛,但是文件最后显示:
Rotating derivatives to standard orientation.
VibFrq with compact Hessian needs NReduc.ne.0
Error termination via Lnk1e in /home/cluster_app/G09/l716.exe 。
请问这种情况应该如何解决呢?
是否在oniom结构优化之后,不可以提取高层分子单独进行频率计算?(输入输出文件在附件)

gu.rar

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发表于 Post on 2019-6-17 20:54:06 | 只看该作者 Only view this author
提取ONIOM高层分子单独进行opt freq计算是无意义的,这相当于你之前的ONIOM完全没有起到任何作用
直接抠出来高层做freq出现虚频几乎是理所应当的,毕竟根本不是当前分子在势能面极小点的结构

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-6-17 21:16:43 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-6-17 20:54
提取ONIOM高层分子单独进行opt freq计算是无意义的,这相当于你之前的ONIOM完全没有起到任何作用
直接抠出 ...

但是老师,在不固定原子进行oniom结构优化之后,整体进行freq也会大量出现虚频的原因是什么呢。以及在oniom结构优化之中加入tight和int=ultranfine,结构优化作业可以完成。但是加入了calcall的关键词就会出现Rotating derivatives to standard orientation.
VibFrq with compact Hessian needs NReduc.ne.0
Error termination via Lnk1e in /home/cluster_app/G09/l716.exe。这是因为什么导致的呢?有什么办法可以解决么

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发表于 Post on 2019-6-17 21:46:32 | 只看该作者 Only view this author
wILlD 发表于 2019-6-17 21:16
但是老师,在不固定原子进行oniom结构优化之后,整体进行freq也会大量出现虚频的原因是什么呢。以及在oni ...

ONIOM整体做完opt freq有虚频就是优化不充分

用calcall不行的话opt里加上nomicro再试
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
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发表于 Post on 2019-6-18 08:30:25 | 只看该作者 Only view this author
ONIOM优化完成以后,再把QM分子取出来计算频率,必然是有虚频的。
因为ONIOM优化过程中,MM部分与QM部分的范德华相互作用会抑制住QM分子的振动,但是一旦放开,就相当于没有了这种限制,所以必然会出现虚频。
所以使用ONIOM得看研究什么问题,有的问题(具体是什么我不说了)能用ONIOM研究并不是该问题本身怎么怎么,而是ONIOM方法决定的——只要使用ONIOM来研究相关问题,必然可以得到相应的结果。
所以ONIOM我觉得还是坚持社长的观念:能不能就尽量不用,否则内行人一问,很容易出现问题。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-6-18 17:38:44 | 只看该作者 Only view this author
让你变成回忆 发表于 2019-6-18 08:30
ONIOM优化完成以后,再把QM分子取出来计算频率,必然是有虚频的。
因为ONIOM优化过程中,MM部分与QM部分的 ...

是的,主要是导师想研究团簇(固体)的材料激发情况。所以用了oniom方法

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