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[Lammps] 新手求助lammps格式转换

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本帖最后由 小西瓜123 于 2018-11-2 14:46 编辑

各位老师,之前从没有接触过代码,求教一个问题我用ms建模后,通过vesta转换成了vasp格式,然后用脚本转换为lammps格式,可是这个脚本我没有权限放在系统bin目录下,需要改脚本的代码,我改了,变成绿色了,请问为什么还是command not found 呢?


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发表于 Post on 2018-11-2 17:38:10 | 只看该作者 Only view this author
前面加上./
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-11-2 18:38:50 | 只看该作者 Only view this author

请问老师,./是加在哪里呢?刚刚开始接触自己编写代码,不太明白

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发表于 Post on 2018-11-3 07:46:34 | 只看该作者 Only view this author
小西瓜123 发表于 2018-11-2 18:38
请问老师,./是加在哪里呢?刚刚开始接触自己编写代码,不太明白

运行的文件名前头,代表此文件是在当前目录
这不叫编写代码,而叫命令行操作,而是基本的linux常识性知识
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-11-3 15:12:36 | 只看该作者 Only view this author
我输入了这个, ./VASP-poscar2lammps.awk 1031-h2.POSCAR > 1031-h2.lammps,然后出现了这个,
-bash: ./VASP-poscar2lammps.awk: /home/wenlanc: bad interpreter: Permission denied
请问老师,我应该怎么改那个脚本文件的第一行呢?

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发表于 Post on 2018-11-3 20:00:32 | 只看该作者 Only view this author
我没用过那脚本
根据报错和脚本实际内容解决
没权限的情况用chmod加可执行权限,不懂就google
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发表于 Post on 2018-11-5 14:38:54 | 只看该作者 Only view this author
小西瓜123 发表于 2018-11-3 15:12
我输入了这个, ./VASP-poscar2lammps.awk 1031-h2.POSCAR > 1031-h2.lammps,然后出现了这个,
-bash: ./ ...

#! /usr/bin/awk -f

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发表于 Post on 2019-8-4 15:57:17 | 只看该作者 Only view this author
这个脚本产生的data文件应该还需要处理吧?

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