求助：BF4阴离子的OPLS力场itp文件生成

sungl123456 · 发表于 Post on 2020-1-15 11:07:23

我想模拟溶剂分子包裹一个离子液体阴阳离子的这样的一个体系，离子液体的阴离子是BF4-，阳离子是[OMIM]+，体系中的溶剂分子和阳离子都可以通过LigParGen生成拓扑文件，但是BF4-会报错，我尝试使用acpype也不行，有没有什么方法能够得到BF4在OPLS力场下的itp文件呢

liuyuje714 · 发表于 Post on 2020-1-15 11:59:23

这种已经有过研究的你最好从文献中去查。
https://github.com/orlandoacevedo/IL?files=1

naoki · 发表于 Post on 2020-1-15 12:33:28

GAFF不支持硼，所以acpype不行。楼上这个链接靠谱，是专门为离子液体优化的OPLS-AA的拓扑。两篇原文如下：
https://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/ct900009a
https://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/acs.jctc.7b00520

Frank · 发表于 Post on 2020-1-15 18:32:13

sungl123456 · 发表于 Post on 2020-1-15 18:50:52

Frank 发表于 2020-1-15 18:32
也可以用这一个 https://github.com/agiliopadua/ilff

有点东西，可以可以

sungl123456 · 发表于 Post on 2020-1-15 18:53:43

liuyuje714 发表于 2020-1-15 11:59
这种已经有过研究的你最好从文献中去查。
https://github.com/orlandoacevedo/IL?files=1

靠谱，厉害厉害，学到了

sungl123456 · 发表于 Post on 2020-1-15 18:54:16

naoki 发表于 2020-1-15 12:33
GAFF不支持硼，所以acpype不行。楼上这个链接靠谱，是专门为离子液体优化的OPLS-AA的拓扑。两篇原文如下：
...

厉害厉害，两篇原文我都会看看

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