本帖最后由 jugengfans 于 2020-7-15 18:31 编辑
我们单位有超算，但是用户太多了，排队排死，而且walltime有两天的限制，做不了更长时间的计算。然后去年大型机故障，数据都清空了，没有及时保存，造成了一定的损失。痛定思痛，还是个人搞个工作站靠谱。然后再弄个群晖DS218+做备份(之前在家玩过群晖918+，觉得快照、异地备份一类还是蛮好用的，有点类似于MAC的时间机器)。看了版主的推荐配置，本来想从淘宝走，但是设备处说要走政府采购，招标/竞价/政府采购网三选一，其中政采支持苏宁京东，不过政采是单独的系统，不是我们平时购物的京东。
结果淘宝商家一听说招标/竞价都不理我了。无奈打开京东政府采购系统。看着某国外大品牌还有某国产大品牌的服务器那跟台式机差不多的配置和不可思议的价格，心灰意冷。
突然想起京东那边，只要是京东自营店的服务器，就算政采网上没有，也都可以根据产品编号，找京东开通政府采购链接，于是抱着试试看的心情去京东搜了搜，打算搜配件自己回来组装的
按照站长Sob大神推荐的配置，配个较好一点的服务器
配置粘贴如下：
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CPU：2* XEON E5-2696 v3（18核2.3G，散，无集显）2*3800
散热器：酷冷至尊T400i*2 80*2
主板：超微 X10DRL-I（C612芯片组，集显） 1700
机械硬盘：希捷ST4000NM0033企业级4TB SATA 480
固态硬盘：PM981A 1TB + M.2到PCI-E转换卡 1030
内存：8*三星DDR4-2400 ECC 16GB 8*400
电源：台达NX650（额定650W） 530
机箱：先马黑洞玻璃版 330
键盘鼠标：罗技MK200 多媒体套装 85
总价：约15100
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搜了一下，机箱的先马黑洞有自营店 超微主板有自营店 硬盘有自营店(硬盘其实我个人用东芝He气盘比较多，现在被西数收购了) 内存三星有自营店。键盘鼠标显示器电源都无所谓了，那些随便什么牌子。
但是！最大的问题是处理器！intel有自营店但是cpu散装的不可能在自营店里买到啊！特别是版主推荐的2696v3没有。v4有搜到结果，但是都是dell一类自营店服务器捆绑的，不能单买。
所以其实走政采攒机，最大的问题就是cpu。
但是逛京东的时候，搜cpu，注意到朴赛这个品牌，2696v4的配置，感觉和版主推荐的有点像
朴赛双路E5 2696-V4/44核心88线程/渲染服务器/仿真计算/CPU运算图形工作站 双路E5+集成显卡 32G内存+250G固态 价格是22999
问了问客服，说主板是超微的，内存是三星，电源是台达，也算都是站长推荐的配置吧。到时候再扩展内存到128G，就行了。
显卡可以自己挑牌子 耕升啊映泰一类的。
然后又看到了一个稍微廉价一些的服务器，这个CPU比较弱但是有一块微星的2080ti独显。
朴赛PT660 E5-2680V3双路图形工作站渲染服务器电脑主机 价格是18999
这个配置是如下这样的
这个有点像版主之前推荐的廉价服务器：
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CPU：2* XEON E5-2678 v3（12核2.5G，散，无集显）2*590
散热器：酷冷至尊T400i*2 80*2
主板：超微 X10DRL-I（C612芯片组，集显） 1700
硬盘：希捷ST4000NM0033企业级4TB SATA 480
内存：三星DDR4-2400 ECC 8*8GB 8*230
电源：台达NX650（额定650W） 530
机箱：先马黑洞玻璃版 330
键盘鼠标：罗技MK200 多媒体套装 85
总价：约6300
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价格差那么多，是因为它配了一个微星的RTX1080Ti 11G显卡，这个在京东上搜了一下，这个在京东自营店价格是10888
当然我不懂为什么朴赛这款内存是2133的频率，应该可以换成2400的吧。
好了，现在了解到的情况就是这样。我个人当然还是倾向于买多核的，因为之前在超算跑vasp都是至少48核起跑的。
所以想问问各位专家两个问题：
1.按照第二个配置，以2680v3计算性能为100%, 2696v3 2696v4的计算性能大概能高多少？v3和v4性能能差多少？
2.vasp我一般都是算DFT，不怎么跑AIMD，那么这个显卡的配置是否太高了？6G显存和11G差别大吗? 低配一点的有没有推荐？
按照朴赛官网的案例，他们好像也配过算Amber和vasp的机器，说vasp用GPU后计算效率最高能快8倍，这个靠谱吗？
http://porserver.cn/product/showproduct.php?id=45
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为VASP定制的系统，带来最高8倍性能提升
通过与诸多大学和科研机构协作，NVIDIA 在今年年初顺利完成了 GPU 加速版VASP。通过对原有包含 FFT 和 BLAS 算法以 cuFFT 和 cuBLAS 替代，新算法能够完全适合 GPU 硬件架构，充分发挥 GPU 的计算潜力。同时，标准密度泛函和杂化泛函计算也均得到了 GPU 支持。
作为NVIDIA在中国最重要的战略合作伙伴之一，容天通过分析 VASP 异构计算特点，进一步设计了可靠的集群解决方案，在 CPU 和 GPU 运行能力、内存数量、网络延时与带宽上达到最佳匹配。
该集群解决方案为每节点配置两块Tesla K40 GPU加速器，并通过EDR InfiniBand 网络缩短 GPU 间的通信延时，增加通信带宽，从硬件层面进一步压缩软件的通信时间。
最终，在进行标准密度泛函和杂化泛函计算性能测试时，达到创纪录的1.4-8 倍加速！
其中，对于 256 原子（ 9K 点） GaAsBi 体系标准密度泛函计算，在最重要的绝对计算时间上，单节点两颗E5 2660 V3 CPU 共 16 核心计算耗时 7546 秒，使用 8 个 MPI 进程和两颗Tesla K40 GPU 计算耗时 1242 秒，达到6 倍加速！ 可以预见，对于大型集群来说，多 GPU 系统会带来更加显著的提速。 杂化泛函计算采用 63 原子、 192 能带和 4K 点 MgO 体系， 16 个 CPU 核心自洽计算耗时 900 秒，使用 4 个 MPI 进程和两颗 Tesla K40 GPU 自洽计算耗时 640 秒。 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
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发表于 Post on 2020-7-15 18:15:29
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发表于 Post on 2020-7-19 13:55:12