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[Multiwfn使用咨询] 关于CDA分析原子顺序不一致的问题

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本帖最后由 小李子赛 于 2020-4-23 16:00 编辑

老师好,分析CDA,我在单点计算复合物时,发现其原子顺序发生了变化,两个片段的原子顺序未发生变化,不知道是哪里出了问题?我加了弥散函数复合物:

输入文件关键词及坐标
#p MP2/genecp nosymm pop=full iop=(3/33=1,3/32=2) 5d 7f










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发表于 Post on 2020-4-13 12:55:55 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 snljty 于 2020-4-13 13:23 编辑

顺便一提,用MP2通常已经不是什么好主意了,用MP2做CDA分析还不用Density=Current(还得改Population=Full,限制型方法改Population=NO,非限制型方法改Population=NOAB),用的是HF级别的波函数做的分析,是很浪费计算力而且低效率的方法。还有你的弥散函数...刚看到GenECP没注意

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发表于 Post on 2020-4-13 13:01:37 | 只看该作者 Only view this author
加了nosymm的情况下,不太可能出现这种情况。上传你的输入输出文件,我看看。

如果没有特殊理由,不建议用MP2,用DFT可以直接用fch,还省得写pop=full iop=(3/33=1,3/32=2)。

如我博文(http://sobereva.com/166)、Multiwfn手册、GCDA论文(http://www.hanspub.org/journal/PaperInformation.aspx?paperID=16370)所述,做CDA强烈不建议带弥散函数,可能导致结果根本没意义或者有极大的误导性。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-4-13 17:28:11 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-4-13 13:01
加了nosymm的情况下,不太可能出现这种情况。上传你的输入输出文件,我看看。

如果没有特殊理由,不建议 ...

老师,由于文件太大上传不了,我把输入输出文件放网盘里了,麻烦老师帮我看一下哪里出了问题,链接:https://pan.baidu.com/s/1AKVuUmMQJB8FdlR3CNsYSQ
提取码:gmxm

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-4-13 17:33:34 | 只看该作者 Only view this author
snljty 发表于 2020-4-13 12:55
顺便一提,用MP2通常已经不是什么好主意了,用MP2做CDA分析还不用Density=Current(还得改Population=Full, ...

我是看前几届的师兄师姐用的这种计算方法,类比算的,老师,如果在算CDA时与之前的优化等其它计算不在同一基组以及计算水平下,对计算结果有影响吗?

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发表于 Post on 2020-4-14 19:32:26 | 只看该作者 Only view this author
小李子赛 发表于 2020-4-13 17:33
我是看前几届的师兄师姐用的这种计算方法,类比算的,老师,如果在算CDA时与之前的优化等其它计算不在同 ...

问题是你写MP2不写Density,结果和用HF没区别啊...

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-4-14 20:06:46 | 只看该作者 Only view this author
snljty 发表于 2020-4-14 19:32
问题是你写MP2不写Density,结果和用HF没区别啊...

哦哦,我明白了。非常感谢

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发表于 Post on 2020-4-15 00:14:03 | 只看该作者 Only view this author
小李子赛 发表于 2020-4-13 17:33
我是看前几届的师兄师姐用的这种计算方法,类比算的,老师,如果在算CDA时与之前的优化等其它计算不在同 ...

显然没影响

不要盲目效仿师兄师姐。实验室祖传的以讹传讹的错误东西就是这么传下来的。
作为CDA代码的开发者(以及GCDA方法的提出者),我认为我在这方面比你师兄师姐更有发言权。

不仅用MP2对于CDA没有任何好处,单纯从理论计算的常识来说,用MP2通常也是非常糟糕、很容易被审稿人骂的做法,仔细看下文中的相关部分
简谈量子化学计算中DFT泛函的选择
http://sobereva.com/272http://bbs.keinsci.com/thread-536-1-1.html

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小李子赛 发表于 2020-4-13 17:28
老师,由于文件太大上传不了,我把输入输出文件放网盘里了,麻烦老师帮我看一下哪里出了问题,链接:http ...

网盘失效了
甭用pop=full,文件能小得多得多

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-4-15 10:50:44 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-4-15 00:15
网盘失效了
甭用pop=full,文件能小得多得多

链接:https://pan.baidu.com/s/1--T-uPkhUp4b6Z3ySX_UPw
提取码:euwh
不好意思老师,我没有注意看有效时间,这个是输入输出文件。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-4-15 11:03:07 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-4-15 00:15
网盘失效了
甭用pop=full,文件能小得多得多

老师,同样的关键词,我使用B3LYP计算方法,得到的坐标还是这个样子。

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发表于 Post on 2020-4-16 13:31:32 | 只看该作者 Only view this author
小李子赛 发表于 2020-4-15 11:03
老师,同样的关键词,我使用B3LYP计算方法,得到的坐标还是这个样子。

你的输出文件里出现了两次nosymm,完全是不合理的
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