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[Gaussian/gview] 如果在Gaussian输入文件中引用两个包含相同元素的基组gbs文件会怎样?

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本帖最后由 Freeman 于 2020-6-29 16:25 编辑

计算一个体系时,需要对A原子用a基组,对B原子用b基组,要引用两个基组gbs文件,但是体系中还有C原子,而两个基组对C原子有不同的定义,那么Gaussian将如何判别?
为了搞清楚这个问题,我编写了3个计算甲烷单点能的gjf文件并计算结果,分别是:

1、对碳、氢原子同时依次用6-311g*和6-31g*基组
输入:31+311.gjf
  1. %mem=4GB
  2. %nprocshared=2
  3. # hf/gen

  4. 31+311

  5. 0 1
  6. C                 -1.05678232    0.29442692    0.00000000
  7. H                 -0.70012789   -0.71438308    0.00000000
  8. H                 -0.70010948    0.79882511    0.87365150
  9. H                 -0.70010948    0.79882511   -0.87365150
  10. H                 -2.12678232    0.29444011    0.00000000

  11. C H 0
  12. 6-311G*
  13. ****
  14. C H 0
  15. 6-31G*
  16. ****
复制代码
输出:31+311.log
  1. SCF Done:  E(RHF) =  -40.2046914159     A.U. after    9 cycles
  2.             NFock=  9  Conv=0.12D-08     -V/T= 1.9982
复制代码

2、对碳、氢原子用6-31g*基组
输入:31.gjf
  1. %mem=4GB
  2. %nprocshared=2
  3. # hf/gen

  4. 31

  5. 0 1
  6. C                 -1.05678232    0.29442692    0.00000000
  7. H                 -0.70012789   -0.71438308    0.00000000
  8. H                 -0.70010948    0.79882511    0.87365150
  9. H                 -0.70010948    0.79882511   -0.87365150
  10. H                 -2.12678232    0.29444011    0.00000000

  11. C 0
  12. 6-31G*
  13. ****
复制代码
输出:31.log
  1. SCF Done:  E(RHF) =  -39.5509359341     A.U. after    8 cycles
  2.             NFock=  8  Conv=0.45D-10     -V/T= 1.9892
复制代码

3、对碳、氢原子用6-311g*基组
输入:311.gjf
  1. %mem=4GB
  2. %nprocshared=2
  3. # hf/gen

  4. 311

  5. 0 1
  6. C                 -1.05678232    0.29442692    0.00000000
  7. H                 -0.70012789   -0.71438308    0.00000000
  8. H                 -0.70010948    0.79882511    0.87365150
  9. H                 -0.70010948    0.79882511   -0.87365150
  10. H                 -2.12678232    0.29444011    0.00000000

  11. C 0
  12. 6-311G*
  13. ****
复制代码
输出:311.log
  1. SCF Done:  E(RHF) =  -39.5960147804     A.U. after    8 cycles
  2.             NFock=  8  Conv=0.59D-08     -V/T= 1.9950
复制代码

311和31的能量都跟31+311对不上。不知何故。



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发表于 Post on 2020-6-29 16:24:16 | 只看该作者 Only view this author
用元素符号会让基组叠加起来,基函数变多,所以你的第一个例子能量最低。

可以用数字,比如1号2号原子都是碳的话,
1 0
6-311G(d)
****
2 0
6-31G(d)
****

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-6-29 16:32:24 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2020-6-29 16:24
用元素符号会让基组叠加起来,基函数变多,所以你的第一个例子能量最低。

可以用数字,比如1号2号原子都 ...

谢谢你!
那么如果不用Gaussian自带的基组,而用数据库上下载的gbs文件,除了修改gbs文件,还有没有办法解决两个基组对某个元素的重叠问题?

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发表于 Post on 2020-6-29 16:36:42 | 只看该作者 Only view this author
我不是很喜欢用gbs文件写法。想要不同基组,直接把基组数据粘贴上去就行了
1 0
基组数据
****
2 0
基组数据
****

如果你非要用gbs文件引用写法,可以试试分别引用,试一下就几十秒就知道答案了。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-6-29 16:38:37 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2020-6-29 16:36
我不是很喜欢用gbs文件写法。想要不同基组,直接把基组数据粘贴上去就行了
1 0
基组数据

好的。谢谢!

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发表于 Post on 2020-6-29 17:25:47 | 只看该作者 Only view this author
gen关键词主要用来使用混合基组。

你的“31+311”相当于定义了一个新基组,把两个基组的基函数全都用上了。sob老师的博文《详解Gaussian中混合基组、自定义基组和赝势基组的输入》http://sobereva.com/60 明确指出”因为对同一个原子重复定义基组的话基函数是累加的关系,而不是覆盖的关系”。

如果你拿这个新基组算SCF能量,SCF能量会降低。如果单纯以计算单点能为目的,这样做可以提高精度(因为基组完备性提高了),但是很不划算。SCF部分的时间消耗大约和GTF的四次方成正比。这么做每一圈耗时增加不少,而且一般来说收敛也会困难,收敛需要的迭代次数也会增加(你的例子里,正常基组8圈收敛,新的基组要9圈)。

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