计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 12884|回复 Reply: 11
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[新手求助] 频率分析不能正常结束

[复制链接 Copy URL]

67

帖子

0

威望

265

eV
积分
332

Level 3 能力者

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
请问老师,我在计算一个大分子的频率时,由于分子较大,300多个原子,总是不能正常结束,显示can not read,增大内存也不行,请问有什么解决方法吗

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125140

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2017-6-21 13:09:23 | 只看该作者 Only view this author
问题要交代详细,用的什么程序、什么关键词等等。而且最起码报错提示要贴完整。
最好上传压缩后的输出文件(如果超过3MB,请用网盘)
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

67

帖子

0

威望

265

eV
积分
332

Level 3 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-6-23 19:05:11 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-6-21 13:09
问题要交代详细,用的什么程序、什么关键词等等。而且最起码报错提示要贴完整。
最好上传压缩后的输出文件 ...

老师,用高斯程序,用的关键词为B3LYP/6-31G*   opt  freq
几何优化收敛了,但是频率读不出来,.log文件的最后为:
Minotr:  Closed shell wavefunction.
          IDoAtm=11111111111111111111111111111111111111111111111111
          IDoAtm=11111111111111111111111111111111111111111111111111
          IDoAtm=11111111111111111111111111111111111111111111111111
          IDoAtm=11111111111111111111111111111111111111111111111111
          IDoAtm=1111111111111111111111111111111111111111111111
          Direct CPHF calculation.
          Differentiating once with respect to electric field.
                with respect to dipole field.
          Differentiating once with respect to nuclear coordinates.
          Requested convergence is 1.0D-08 RMS, and 1.0D-07 maximum.
          Secondary convergence is 1.0D-12 RMS, and 1.0D-12 maximum.
          NewPWx=T KeepS1=F KeepF1=F KeepIn=T MapXYZ=F SortEE=F KeepMc=T.
          MDV=     671083944 using IRadAn=       2.
Generate precomputed XC quadrature information.
          Solving linear equations simultaneously, MaxMat=      72.
FoF2E skips out because all densities are zero.
CalDSu exits because no D1Ps are significant.
FoFJK:  IHMeth= 1 ICntrl=       0 DoSepK=F KAlg= 0 I1Cent=   0 FoldK=F
IRaf= 290000000 NMat=  48 IRICut=       1 DoRegI=T DoRafI=F ISym2E= 2.
FoFCou: FMM=T IPFlag=           0 FMFlag=      100000 FMFlg1=        2001
         NFxFlg=           0 DoJE=F BraDBF=F KetDBF=F FulRan=T
         wScrn=  0.000000 ICntrl=       0 IOpCl=  0 I1Cent=           0 NGrid=           0
         NMat0=   48 NMatS0=     48 NMatT0=    0 NMatD0=   48 NMtDS0=    0 NMtDT0=    0
Symmetry not used in FoFCou.
FMM levels:  10  Number of levels for PrismC:   9
          There are   741 degrees of freedom in the 1st order CPHF.  IDoFFX=6 NUNeed=     3.

4289

帖子

4

威望

9541

eV
积分
13910

Level 6 (一方通行)

MOKIT开发者

4#
发表于 Post on 2017-6-23 19:31:31 | 只看该作者 Only view this author
“频率读不出来”实际上你是指的GV打开时弹框报错?还是log本身就异常结束?能做完opt?那不如opt完了提取最后一个结构出来单独做freq,反复增大内存提交opt+freq浪费时间啊,那不是重复了好多次opt?
自动做多参考态计算的程序MOKIT

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125140

管理员

公社社长

5#
发表于 Post on 2017-6-23 21:00:22 | 只看该作者 Only view this author
落花飘雨679 发表于 2017-6-23 19:05
老师,用高斯程序,用的关键词为B3LYP/6-31G*   opt  freq
几何优化收敛了,但是频率读不出来,.log文 ...

任务异常终止,重算一遍。还不行就换版本
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

67

帖子

0

威望

265

eV
积分
332

Level 3 能力者

6#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-6-25 09:03:02 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-6-23 21:00
任务异常终止,重算一遍。还不行就换版本

老师重算后还是不能正常结束,老师说的换版本是换高斯的版本吗

1102

帖子

18

威望

6703

eV
积分
8165

Level 6 (一方通行)

計算化学の社畜

7#
发表于 Post on 2017-6-25 09:22:45 | 只看该作者 Only view this author
落花飘雨679 发表于 2017-6-25 09:03
老师重算后还是不能正常结束,老师说的换版本是换高斯的版本吗

Stand on the shoulders of giants

67

帖子

0

威望

265

eV
积分
332

Level 3 能力者

8#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-6-25 09:25:17 | 只看该作者 Only view this author

高斯的版本不知道怎么换

1102

帖子

18

威望

6703

eV
积分
8165

Level 6 (一方通行)

計算化学の社畜

9#
发表于 Post on 2017-6-25 09:31:43 | 只看该作者 Only view this author
落花飘雨679 发表于 2017-6-25 09:25
高斯的版本不知道怎么换


链接:http://pan.baidu.com/s/1bpKo6uj 密码:****
Stand on the shoulders of giants

67

帖子

0

威望

265

eV
积分
332

Level 3 能力者

10#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-6-25 09:35:24 | 只看该作者 Only view this author

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125140

管理员

公社社长

11#
发表于 Post on 2017-6-25 15:12:31 | 只看该作者 Only view this author


由于隔墙有耳,敏感内容不建议发在明面上。所以把密码用****替换了
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

7

帖子

0

威望

91

eV
积分
98

Level 2 能力者

12#
发表于 Post on 2020-7-16 20:19:13 | 只看该作者 Only view this author
你好同学,我遇到了和你一模一样的问题,请问您解决了掉了么,感谢求指导

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-20 23:41 , Processed in 0.193091 second(s), 20 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list