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[GROMACS] 求助做直链淀粉和小分子分子模拟报错Invalid order for directive atomtypes

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      大家好。我自己做的直链淀粉分子,然后用sobtop生成的gro和top,itp文件,现在进行添加粒子的适合一直报错,看了很多论坛方案,都行不通。
Fatal error:
Syntax error - File rutin.itp, line 3
Last line read:
'[ atomtypes ]'
Invalid order for directive atomtypes


现附上top文件,大家指导一下。

344.png (71.78 KB, 下载次数 Times of downloads: 11)

344.png

topol.top

1.73 KB, 下载次数 Times of downloads: 5

rutin.top

339 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 2

amy.rtp

513.33 KB, 下载次数 Times of downloads: 2

rutin.rtp

52.08 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

rutin.itp

69.5 KB, 下载次数 Times of downloads: 8

amy.top

333 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 1

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发表于 Post on 2023-9-24 19:49:07 | 只看该作者 Only view this author
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发表于 Post on 2023-9-25 01:41:17 | 只看该作者 Only view this author
老生常谈的问题,都回答过无数次了,论坛首页全文搜索框搜Invalid order for directive atomtypes
明显rutin.itp里不能出现[atomtypes]
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-9-25 08:52:41 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-9-25 01:41
老生常谈的问题,都回答过无数次了,论坛首页全文搜索框搜Invalid order for directive atomtypes
明显rut ...

谢谢sob老师,感谢感谢。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-9-25 10:08:02 | 只看该作者 Only view this author
牧生 发表于 2023-9-24 19:49
http://bbs.keinsci.com/thread-38840-1-1.html

谢谢,谢谢。

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