使用高斯09优化后生成的chk文件再用高斯16加色散校正优化

XiaoYan · 发表于 Post on 2020-7-13 10:06:07

最近在工作中遇到一个问题，原本使用的g09版本优化的所有小分子结构。但是导师要求用g16添加色散校正重新优化。g16优化的输入文件采用了读取g09优化生成chk文件的方式（keyword: geom=allcheck)。感觉采用此方法优化消耗的时间较长，我想知道采用g09优化后的结构重新做输入文件，这样的优化速度是否会快一点？（ps:时间比较紧张，没有多余的机时做比较了）

sobereva · 发表于 Post on 2020-7-13 11:29:05

完全是一样的，耗时没差别

snljty · 发表于 Post on 2020-7-13 11:32:05

你看看G16和G09的默认设置不一样，比如DFT积分格点的精度，双电子积分忽略的阈值等等。是不是你没改这些设置，导致误以为G16比G09慢的。不明白的话可以在关键词中加入G09Defaults

zjxitcc · 发表于 Post on 2020-7-13 13:13:41

本帖最后由 zjxitcc 于 2020-7-13 13:16 编辑

“感觉采用此方法优化消耗的时间较长”是因为做法有误，G16加了G09Defaults之后是明显比G09快很多的。

PS：不建议用G16去读G09的chk文件，最好先用G09的formchk把chk转化为fchk文件，再用G16的unfchk把fchk文件转化为chk文件。当然，若你已经直接读了chk文件并且没发现警告或者异常，大概率就是没事的。

XiaoYan · 发表于 Post on 2020-7-13 14:19:08

sobereva 发表于 2020-7-13 11:29
完全是一样的，耗时没差别

谢谢

XiaoYan · 发表于 Post on 2020-7-13 14:30:47

snljty 发表于 2020-7-13 11:32
你看看G16和G09的默认设置不一样，比如DFT积分格点的精度，双电子积分忽略的阈值等等。是不是你没改这些设 ...

g16的输入文件已使用g09在相同精度的基组和泛函下优化过一次，再用g16优化时应该很快能收敛。所以我才会觉得它收敛速度偏慢。

snljty · 发表于 Post on 2020-7-13 14:58:27

XiaoYan 发表于 2020-7-13 14:30
g16的输入文件已使用g09在相同精度的基组和泛函下优化过一次，再用g16优化时应该很快能收敛。所以我才会 ...

控制精度的远不止泛函和基组这两个参数。比如上面提到的一些都是默认的，可以不用自己设置，但是G09和G16默认的不一样。同样原理两者计算结果也不宜直接相减。

naonao5205 · 发表于 Post on 2020-7-13 15:04:16

g16并行效率是明显高于g09的如果仅仅是添加色散的话 geom=allcheck em=XXX g09defaults就行
This keyword restore the calculation defaults from Gaussian 09. It is equivalent to:
Integral=(FineGrid,Acc2E=10) Constants=2006 SCRF=G09Defaults
int显然会影响耗时和结果

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