gmx可以提交服务器计算吗？可以实现超声震荡的实验环境吗

baima · 发表于 Post on 2020-8-20 17:17:12

大家好！刚开始学习gmx，两个问题想请教
1.只看到gmx可以GPU加速，但是虚拟机好像用不了？实验室有服务器，用MS的时候可以像图片上这样选择服务器的gateway location这样来加速计算，gmx可以吗

2.gmx可以模拟超声震荡的实验环境吗？初步设想是给溶剂分子施加

这种压力，来实现模拟短时间的超声震荡对分子的影响，是要通过mdp里非平衡参数的设定吗，但是好像只能设定恒定的加速度，或者通过压力耦合？但是也不知道具体怎么设定

thanhtam · 发表于 Post on 2020-8-20 17:41:10

本帖最后由 thanhtam 于 2020-8-20 17:42 编辑

1. 当然可以。在服务器上安装即可http://bbs.keinsci.com/thread-11821-1-1.html

少年爱吃地三鲜 · 发表于 Post on 2020-8-20 19:20:33

你查手册全都是

sobereva · 发表于 Post on 2020-8-20 22:56:40

求助时不要把问题序号写在帖子标题里，给你改了

1 本来就没道理在虚拟机里用。Windows下GPU加速有我编译好的现成版本
GROMACS的原生Windows版的编译和安装方法（支持GPU加速）
http://sobereva.com/458（http://bbs.keinsci.com/thread-11848-1-1.html）

M$那根本就不叫什么加速计算，那叫在远程服务器上运算，搞清楚基本逻辑

2 没法设。需要自己改程序

baima · 发表于 Post on 2020-8-21 09:32:06

本帖最后由 baima 于 2020-8-27 09:19 编辑

sobereva 发表于 2020-8-20 22:56
求助时不要把问题序号写在帖子标题里，给你改了

1 本来就没道理在虚拟机里用。Windows下GPU加速有我编译 ...

谢谢sob老师的回复！

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