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[新手求助] 求助(Y2O3)2团簇结构优化方法和基组的选择

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卢老师你好,我准备对一个金属氧化物团簇结构进行优化,现在初始结构已经搭建完成,金属氧化物为(Y2O3)2,含有4个钇原子,6个氧原子,我用的是Linux系统下的Gaussian16,40核,能接受的计算时长不做要求,请问我该选用何种方法和基组?

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发表于 Post on 2020-9-20 07:39:46 | 只看该作者 Only view this author
这么小体系,直接用def2-TZVP
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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发表于 Post on 2020-9-20 11:42:42 | 只看该作者 Only view this author
泛函可考虑B2PLYP等双杂化泛函
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-9-30 17:22:40 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-9-20 07:39
这么小体系,直接用def2-TZVP

卢老师,你好,昨天我在QQ群里咨询了优化稀土氧化物团簇(5-50个原子)的问题,您提到对于几十个原子的体系用def2-TZVP耗时太高的问题,推荐我用SDD搭配6-311G*,我查了手册后,写的其中一个输入文件见附件,运行了并没有报错,您看上述所有团簇体系是否都可用这种方法和基组?

Pseudo部分关键词.png (64.02 KB, 下载次数 Times of downloads: 47)

部分关键词截图

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Y609.gjf

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高斯输入文件

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发表于 Post on 2020-9-30 19:13:39 | 只看该作者 Only view this author
蒋小乐 发表于 2020-9-30 17:22
卢老师,你好,昨天我在QQ群里咨询了优化稀土氧化物团簇(5-50个原子)的问题,您提到对于几十个原子的体 ...

关键词没问题。
没必要刻意写MWB28,直接写SDD多省事,仔细看
详解Gaussian中混合基组、自定义基组和赝势基组的输入
http://sobereva.com/60
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-9-30 19:20:26 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-9-30 19:13
关键词没问题。
没必要刻意写MWB28,直接写SDD多省事,仔细看
详解Gaussian中混合基组、自定义基组和赝 ...

好的 谢谢老师了 同时祝老师中秋快乐,工作顺利,合家欢乐!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-10-11 10:08:17 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-9-30 19:13
关键词没问题。
没必要刻意写MWB28,直接写SDD多省事,仔细看
详解Gaussian中混合基组、自定义基组和赝 ...

老师你好 计算体系电子能量时,可否继续用该方法和基组,是否要选用更高级别的基组?

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发表于 Post on 2020-10-11 10:14:28 | 只看该作者 Only view this author
蒋小乐 发表于 2020-10-11 10:08
老师你好 计算体系电子能量时,可否继续用该方法和基组,是否要选用更高级别的基组?

算的动的话可以考虑CCSD(T),或者降到双杂化,基组最少也要用def2tzvp

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-10-11 10:22:39 | 只看该作者 Only view this author
biogon 发表于 2020-10-11 10:14
算的动的话可以考虑CCSD(T),或者降到双杂化,基组最少也要用def2tzvp

好的,我计算试试看

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发表于 Post on 2020-10-11 17:38:49 | 只看该作者 Only view this author
蒋小乐 发表于 2020-10-11 10:22
好的,我计算试试看

团簇的话CCSD(T)未必靠谱,还是要看静态相关的情况

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-10-12 09:53:47 | 只看该作者 Only view this author
喵星大佬 发表于 2020-10-11 17:38
团簇的话CCSD(T)未必靠谱,还是要看静态相关的情况

昨天我试了CCSD(T),算不动,而且空间占用很大,请问老师对于该体系单点能的计算有没有推荐的方法和基组?

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发表于 Post on 2020-10-12 11:07:01 | 只看该作者 Only view this author
蒋小乐 发表于 2020-10-12 09:53
昨天我试了CCSD(T),算不动,而且空间占用很大,请问老师对于该体系单点能的计算有没有推荐的方法和基组? ...

如果高斯的话CCSD(T)当然是算不动咯,可以用ORCA的DLPNO-CCSD(T)或者双杂化,速度还可以,就是SCF相当难收敛,可能需要用VerySlowConv之类的关键词,然而即使这样也很有可能不收敛,稀土金属团簇本来就是难收敛的体系

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发表于 Post on 2020-10-12 11:10:29 | 只看该作者 Only view this author
喵星大佬 发表于 2020-10-12 11:07
如果高斯的话CCSD(T)当然是算不动咯,可以用ORCA的DLPNO-CCSD(T)或者双杂化,速度还可以,就是SCF相当难 ...

他估计搞不定,DLPNO占硬盘也很严重
自动做多参考态计算的程序MOKIT

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发表于 Post on 2020-10-12 11:13:05 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2020-10-12 11:10
他估计搞不定,DLPNO占硬盘也很严重

我寻思稀土金属团簇本来就是很难搞得玩意,原理上应该用多参考但那玩意更麻烦

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-10-12 22:07:44 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-9-30 19:13
关键词没问题。
没必要刻意写MWB28,直接写SDD多省事,仔细看
详解Gaussian中混合基组、自定义基组和赝 ...

老师你好,对于上述体系OPT+freq采用B3LYP泛函,基组选用SDD搭配6-311G*;计算单点能采用双杂化泛函B2PLYP/def2tzvp,请问这样是否合理可行?

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