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[综合交流] 求助,弱氢键主导的质子解离过渡态TS搜寻问题

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楼主
本帖最后由 j5888xm 于 2020-10-19 17:15 编辑

求助各位老师,我计算一个两分子体系的过渡态,为 α-H在溶剂下的离解过程,体系内有明显的pi-pi堆积作用,使用B3LYP(D3)/6-31G(d,p)级别下计算,多次尝试无果,均找不到正常的过渡态,过渡态初猜均为半经验柔性扫描的突跃点。

根据sob老师JCC文章的方法,计算所得 α-H
与溶剂间的氢键约为6~7kJ/mol。


询问各位老师几个问题:

一、对于弱相互作用明显的体系,只用加了D3矫正的B3LYP是不是还不够,需要考虑换M06-2X(D3)吗?还是说简化分子,然后使用CCSD(T)/cc-pvtz找过渡态。

二、若是弱氢键主导质子离解,那么这个强度的弱氢键和偶极作用有无明显差别。

谢谢大家。

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发表于 Post on 2020-10-19 19:55:32 | 只看该作者 Only view this author
B3LYP-D3一般够了,如果不够那也是因为BSSE,通过加大基组或counterpoise的方法减小BSSE的情况下,B3LYP-D3一般不致有定性问题。
什么叫柔性扫描的突跃点?如果指的是扫描过程中能量增加然后突然断崖式下跌,那不叫过渡态,说明你选的扫描坐标不合理。建议想办法得到一个更好的过渡态结构初猜
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
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发表于 Post on 2020-10-19 20:14:01 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2020-10-19 19:55
B3LYP-D3一般够了,如果不够那也是因为BSSE,通过加大基组或counterpoise的方法减小BSSE的情况下,B3LYP-D3 ...

他应该是溶剂模型的问题,我看了是个涉及显式溶剂的反应,但是既没有显式溶剂甚至隐式溶剂都没加,显然找不到,气相下整一个单质子的能量还是很高的

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