算小分子激发态的dynamics有哪些入门读物？

算一算 · 发表于 Post on 2020-10-28 12:48:01

比如说氯仿分子，想算它和激光反应之后几十飞秒内的各原子核运动变化，要上手这样的计算应该怎么入门？用哪些程序比较好，高斯还是什么别的（最好是免费的）？如果是高斯的话，是不是用TDDFT+BOMD算就行？还是说这种体系要用更高理论级别？
有哪些入门必读的paper或是哪些书的哪一章？网上的免费教程也行

sobereva · 发表于 Post on 2020-10-28 14:55:48

属于real-time TDDFT (RT-TDDFT)应用范畴问题，论坛里有多次讨论，先用公社论坛首页google框搜索

喵星大佬 · 发表于 Post on 2020-10-28 15:12:34

NWChem
比如这个J. Chem. Theory Comput. 2015, 11, 4294

wxhwbh · 发表于 Post on 2020-10-28 18:35:49

我不确定氯仿是否涉及势能面锥形交叉。如果涉及的话对锥形交叉的区域TDDFT不一定描述得好，用多参考态电子结构计算的势能面结合非绝热动力学方法才会得到比较好的结果。
当然一般用TDDFT也问题不大，比如pyxaid这种就是TDDFT结合surface hopping做非绝热动力学。

算一算 · 发表于 Post on 2020-10-30 08:18:39

喵星大佬发表于 2020-10-28 15:12
NWChem
比如这个J. Chem. Theory Comput. 2015, 11, 4294

谢谢！

算一算 · 发表于 Post on 2020-10-30 08:20:35

wxhwbh 发表于 2020-10-28 18:35
我不确定氯仿是否涉及势能面锥形交叉。如果涉及的话对锥形交叉的区域TDDFT不一定描述得好，用多参考态电子 ...

谢谢，那非绝热动力学有哪些入门读物吗？哪些经典文章可读？最好是对实操有帮助的

算一算 · 发表于 Post on 2020-10-30 09:58:47

喵星大佬发表于 2020-10-28 15:12
NWChem
比如这个J. Chem. Theory Comput. 2015, 11, 4294

NWChem能记录每一步的波函数吗？

算一算 · 发表于 Post on 2020-10-30 10:01:00

sobereva 发表于 2020-10-28 14:55
属于real-time TDDFT (RT-TDDFT)应用范畴问题，论坛里有多次讨论，先用公社论坛首页google框搜索

哪个程序做rt-tddft可以记录每一步的波函数？比如我想射0.1飞秒为一步，跑几百步，想把其中几十步的波函数记录下来

sobereva · 发表于 Post on 2020-10-31 09:25:16

算一算发表于 2020-10-30 10:01
哪个程序做rt-tddft可以记录每一步的波函数？比如我想射0.1飞秒为一步，跑几百步，想把其中几十步的波函 ...

octopus应当可以，但我没试过

当前这个问题和一般说的非绝热动力学不是同一个路子

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[综合交流] 算小分子激发态的dynamics有哪些入门读物？