计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 8659|回复 Reply: 6
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[波函数分析求助] 关于电子密度的计算问题

[复制链接 Copy URL]

57

帖子

0

威望

1258

eV
积分
1315

Level 4 (黑子)

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
我想用激发态的电子密度(整体激发)来解释取代基效应对激发态能量的影响,于是选择用Elec-Hole来算,感觉非常好用,特别是有定量的Elec-Hole difference,与我的计算结果十分相符。可我的导师说这个方法太新,让我找一个经典的方法来佐证一下,请问有什么方法比较合适?另外,我个人觉得在算电子密度时应该加上density=current,可是加不加对于Elec-Hole difference都一样,那这一关键词到底是用来算什么的?

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120132

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2020-11-10 02:17:34 | 只看该作者 Only view this author
Multiwfn的hole-electron分析并不算多新,2013年就提出来了,之后都有上百篇使用hole-electron分析的文章发表,包括Nature Photonics等一堆影响力很高的刊物文章(今年我发的Carbon, 165, 461 (2020)也用了此方法,文章的补充材料里对此方法原理进行了简明扼要的介绍),根本不用担心会被质疑什么。没有能取代hole-electron分析价值的“经典”方法。

Multiwfn是基于分子轨道和组态系数计算的hole和electron,而density=current写不写只影响是否往chk/fch文件里记录激发态弛豫密度的密度矩阵,因此不会影响空穴-电子分析。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

57

帖子

0

威望

1258

eV
积分
1315

Level 4 (黑子)

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-11-10 06:14:45 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-11-9 19:17
Multiwfn的hole-electron分析并不算多新,2013年就提出来了,之后都有上百篇使用hole-electron分析的文章发 ...

感谢Sob老师非常详细解答,我本来打算用3.21.3 Analyze charge-transfer based on density difference grid data算一下的

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120132

管理员

公社社长

4#
发表于 Post on 2020-11-11 00:43:54 | 只看该作者 Only view this author
clayer 发表于 2020-11-10 06:14
感谢Sob老师非常详细解答,我本来打算用3.21.3 Analyze charge-transfer based on density difference gr ...

这明显没有空穴-电子分析好,因为此方法相当于是对空穴和电子重叠部分互相抵消后对应的密度差进行的分析,因此许多关于空穴和电子分布的信息已经消失了,空穴和电子也不再满足归一化。只有当用的理论方法是目前不被空穴-电子分析支持的方法如EOM-CCSD,才值得考虑用这个方法基于密度差来分析。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

57

帖子

0

威望

1258

eV
积分
1315

Level 4 (黑子)

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-11-17 18:27:17 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 clayer 于 2020-11-17 11:40 编辑
sobereva 发表于 2020-11-10 17:43
这明显没有空穴-电子分析好,因为此方法相当于是对空穴和电子重叠部分互相抵消后对应的密度差进行的分析 ...

我看了Sob老师发表在Carbon上的文章,以及用Elec-Hole来分析电荷分布的文章,但都只用isosurface来呈现分布,而我计算了各原子的net elec and hole值以及用IFCT计算了取代基对应主体分子在激发过程中的电子转移量,这些值对我非常重要,请问Sob老师知道有哪些引用的文章计算了这些数值吗?

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120132

管理员

公社社长

6#
发表于 Post on 2020-11-18 02:43:08 | 只看该作者 Only view this author
clayer 发表于 2020-11-17 18:27
我看了Sob老师发表在Carbon上的文章,以及用Elec-Hole来分析电荷分布的文章,但都只用isosurface来呈现分 ...

IFCT方法应当引用Multiwfn手册3.21.8节。如果你想再用实际应用支持一下的话,可以写“IFCT方法已被用于大量体系的研究,比如文献...”,引用一下Multiwfn用户使用IFCT分析发表的一些文章,比如(Google学术搜文章名可找到)

Experimental and DFT Studies on the FT-IR, NMR and UV-Vis Spectra of a Xanthene Derivative
Functionalized Pt(II) and Ir(III) NIR emitters and their covalent conjugates with polymer-based nanocarriers
A Rare Type of Rhenium(I) Diimine Complexes with Unsupported Coordinated Phosphine Oxide Ligands
Bicolor switching mechanism of multifunctional light-emitting molecular material in solid phase
Enhanced photoelectric and photocatalysis performances of quinacridone derivatives by forming D-π-A-A structure
Excited electronic states' properties of guanine quartet complexes with alkali metal cations
PtAu3 Cluster Complexes with Narrow-band Emission for Solution-Processed Organic Light Emitting Diodes
NIR emitting platinum pincer complexes based on the N^N^C ligand containing {benz[4,5]imidazo[1,2-a]pyrazin} aromatic system; synthesis, characterization and photophysical study
Theoretical insights on Type I-II photoreactions of potential Zn(II) polypyridyl photosensitizers for two-photon photodynamic therapy
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

57

帖子

0

威望

1258

eV
积分
1315

Level 4 (黑子)

7#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-11-18 16:07:11 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-11-17 19:43
IFCT方法应当引用Multiwfn手册3.21.8节。如果你想再用实际应用支持一下的话,可以写“IFCT方法已被用于大 ...

非常感谢Sob老师!

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2025-8-15 00:28 , Processed in 0.171936 second(s), 20 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list