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[Sobtop] Sobtop拓扑类型分类脚本

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Level 4 (黑子)

   各位老师好,小弟最近用sobtop生成了腐殖酸的itp文件,但发现拓扑类型并没有写出通用的形式,这样不方便进行更复杂分子的建模。例如下图中,只需知道每种Type的力场便可以知道这些Type随机排列组合为更大分子的力场。因此小弟写了一个脚本对生成通用形式拓扑类型的脚本

输入命令为:   python code.py input.itp output.itp

希望能帮助有同样问题的朋友。

123.png (144.3 KB, 下载次数 Times of downloads: 34)

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code.py

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代码

input.itp

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输入文件

output.itp

14.61 KB, 下载次数 Times of downloads: 8

输出文件

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