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[综合交流] 求助离子解离反应速率常数的计算方法

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计算了一个分子的光电离解离过程,一个中性分子被打掉一个电子之后生成带一个正电荷的离子,这个离子再经过一系列的过渡态中间体等最后变成一个碎片离子和一个中性分子。想要计算产物的生成速率与实验上测到的质谱峰相对强度进行对比,实验条件大概只有几K的温度,10^-2Pa的压力。

请问这种反应速率可以用平时计算化学反应速率的软件例如MESS,KiSThelP来计算吗?  
另外有在类似的文献中看到有人利用MassKinetics计算,但是自己在安装的时候一致报错,请问有老师知道这个问题应该怎么解决吗?


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发表于 Post on 2020-11-19 21:06:15 | 只看该作者 Only view this author
刚打掉电子的时候,这个正离子会从光子获得振动能,也就是正离子刚生成的时候比环境要“热”。对于你的体系,可否假设这个正离子是先和环境热平衡了,再解离的?
能和不能的情况下是两种完全不同的处理方法。
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
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发表于 Post on 2020-11-20 04:05:37 | 只看该作者 Only view this author
Grimme专门提出了基于AIMD的质谱计算方法,看
Angew. Chem. Int. Ed. 2013, 52, 6306 –6312
J. Phys. Chem. A, 2016, 120 (21), pp 3755–3766
ACS Omega 2019 4 (12), 15120-15133
Angew这篇里讨论了大量细节,就算不用他的方法,也有助于了解考虑质谱中解离问题的基本思想
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-11-20 08:55:10 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2020-11-19 21:06
刚打掉电子的时候,这个正离子会从光子获得振动能,也就是正离子刚生成的时候比环境要“热”。对于你的体系 ...

谢谢老师的回答,我想要计算的过程就是利用“热”的正离子内部的能量去进行后续的反应,应该是没有和环境达到热平衡的,这样是不是就不能利用平时计算化学反应速率的方法去进行计算了呢?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-11-20 08:55:30 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-11-20 04:05
Grimme专门提出了基于AIMD的质谱计算方法,看
Angew. Chem. Int. Ed. 2013, 52, 6306 –6312
J. Phys. Ch ...

好的,感谢sob老师!

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发表于 Post on 2020-11-20 10:45:21 | 只看该作者 Only view this author
pet 发表于 2020-11-20 08:55
谢谢老师的回答,我想要计算的过程就是利用“热”的正离子内部的能量去进行后续的反应,应该是没有和环境 ...

对,必须用sob老师说的AIMD方法
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
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