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[综合交流] 求助离子解离反应速率常数的计算方法

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发表于 2020-11-19 17:17:53 | 显示全部楼层 |阅读模式
计算了一个分子的光电离解离过程,一个中性分子被打掉一个电子之后生成带一个正电荷的离子,这个离子再经过一系列的过渡态中间体等最后变成一个碎片离子和一个中性分子。想要计算产物的生成速率与实验上测到的质谱峰相对强度进行对比,实验条件大概只有几K的温度,10^-2Pa的压力。

请问这种反应速率可以用平时计算化学反应速率的软件例如MESS,KiSThelP来计算吗?  
另外有在类似的文献中看到有人利用MassKinetics计算,但是自己在安装的时候一致报错,请问有老师知道这个问题应该怎么解决吗?

微信图片_20201119171652.png

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发表于 2020-11-19 21:06:15 | 显示全部楼层
刚打掉电子的时候,这个正离子会从光子获得振动能,也就是正离子刚生成的时候比环境要“热”。对于你的体系,可否假设这个正离子是先和环境热平衡了,再解离的?
能和不能的情况下是两种完全不同的处理方法。

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公社社长+计算化学玩家

发表于 2020-11-20 04:05:37 | 显示全部楼层
Grimme专门提出了基于AIMD的质谱计算方法,看
Angew. Chem. Int. Ed. 2013, 52, 6306 –6312
J. Phys. Chem. A, 2016, 120 (21), pp 3755–3766
ACS Omega 2019 4 (12), 15120-15133
Angew这篇里讨论了大量细节,就算不用他的方法,也有助于了解考虑质谱中解离问题的基本思想
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 楼主| 发表于 2020-11-20 08:55:10 | 显示全部楼层
wzkchem5 发表于 2020-11-19 21:06
刚打掉电子的时候,这个正离子会从光子获得振动能,也就是正离子刚生成的时候比环境要“热”。对于你的体系 ...

谢谢老师的回答,我想要计算的过程就是利用“热”的正离子内部的能量去进行后续的反应,应该是没有和环境达到热平衡的,这样是不是就不能利用平时计算化学反应速率的方法去进行计算了呢?

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 楼主| 发表于 2020-11-20 08:55:30 | 显示全部楼层
sobereva 发表于 2020-11-20 04:05
Grimme专门提出了基于AIMD的质谱计算方法,看
Angew. Chem. Int. Ed. 2013, 52, 6306 –6312
J. Phys. Ch ...

好的,感谢sob老师!

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发表于 2020-11-20 10:45:21 | 显示全部楼层
pet 发表于 2020-11-20 08:55
谢谢老师的回答,我想要计算的过程就是利用“热”的正离子内部的能量去进行后续的反应,应该是没有和环境 ...

对,必须用sob老师说的AIMD方法
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