高斯报错求助。几何优化能完成，但是频率振动计算一直跑不出来恳请提供一些解决办法

qq1966789 · 发表于 Post on 2025-10-20 11:55:48

高斯报错求助。几何优化完成的很快，但是频率振动计算一直跑不出来。cif文件是我从ccdc上面下载的。我从《基于分子晶体cif文件抠出分子团簇结构》这里面分别抠出2、3、4、5、6、8分子，其中2、3、4、5分子很快就跑完了，6、8分子chk频率振动计算一直跑不出来。恳请提供一些解决办法。

wzkchem5 · 发表于 Post on 2025-10-20 13:58:33

上传完整输出文件以及stderr输出

qq1966789 · 发表于 Post on 2025-10-20 15:03:41

wzkchem5 发表于 2025-10-20 13:58
上传完整输出文件以及stderr输出

好的，这是6分子的输出文件，用服务器跑了一个月然后蓝屏中断了，中断了几次。通过网盘分享的文件：cu_GG_6M.chk等2个文件
链接: https://pan.baidu.com/s/1GLVPHpP5fr9zG50oKEwx5A?pwd=7a82 提取码: 7a82

sobereva · 发表于 Post on 2025-10-20 23:14:05

提问时自觉给出相关文章的链接，别人都不知道《基于分子晶体cif文件抠出分子团簇结构》指的是什么

不小体系的计算一律用Linux版，甭拿如同玩具的Windows版Gaussian做计算，下文明确说了
Gaussian的安装方法及运行时的相关问题
http://sobereva.com/439（http://bbs.keinsci.com/thread-10814-1-1.html）

KazusaT · 发表于 Post on 2025-10-21 02:20:52

本帖最后由 KazusaT 于 2025-10-21 02:23 编辑

虽然我不知道你的目的是什么，但我觉得你大概率需要恰当冻结一些原子做结构优化才能拿到你想要的结构
我曾经做过182原子普通有机物的结构优化，在使用半经验方法预优化的情况下，36核计算，Linux，Gaussian 16 C.02，B3LYP-D3(BJ)/Def2-SVP优化35步收敛+振动分析总共耗时21小时左右，你的输出文件写着：

******************************************
Gaussian 16: EM64W-G16RevA.03 17-Dec-2016
11-Sep-2025
******************************************
%nprocshared=25
Will use up to 25 processors via shared memory.
%mem=54GB
%chk=E:\Gaussian_Data\C4H8N2O3\cu_GG_6M.chk
----------------------------------------------------
#p opt=(calcall,cartesian) freq b3lyp/6-311G* em=gd3
----------------------------------------------------

复制代码

calcall的情况下我看你每一步都要用个两个半小时左右，out文件也没有明显报错，你的初始结构离极小点也很远，大概率就是没算完而已。
我强烈建议你在linux下算，不方便换系统的话可以用虚拟机，不想折腾的话至少也看看sob老师相关的帖子，用一些方法节约耗时（包括结合你的目的恰当设置计算方法）

qq1966789 · 发表于 Post on 2025-10-21 09:07:44

sobereva 发表于 2025-10-20 23:14
提问时自觉给出相关文章的链接，别人都不知道《基于分子晶体cif文件抠出分子团簇结构》指的是什么

不小 ...

好的，谢谢社长的指导

qq1966789 · 发表于 Post on 2025-10-21 09:08:09

KazusaT 发表于 2025-10-21 02:20
虽然我不知道你的目的是什么，但我觉得你大概率需要恰当冻结一些原子做结构优化才能拿到你想要的结构
我曾 ...

好的，谢谢指导

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