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[NAMD] 求助,NAMD可以计算MM-PBSA吗

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楼主
最近在研究蛋白质-配体相互作用,了解到可以计算结合自由能。其中MM-PBSA/GBSA应用比较广泛,也相对较为简单,想问一下在NAMD中可以计算MM-PBSA吗,没有找到这方面的资料,请大神指教

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发表于 Post on 2022-9-29 05:02:52 | 只看该作者 Only view this author
程序自身算不了
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-9-29 09:20:24 | 只看该作者 Only view this author

感谢回复,那有什么别的方案吗,还是只能换个软件计算

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发表于 Post on 2022-9-29 12:05:05 | 只看该作者 Only view this author
qingqingdong 发表于 2022-9-29 09:20
感谢回复,那有什么别的方案吗,还是只能换个软件计算

要结合iapbs interface

https://mccammon.ucsd.edu/iapbs/

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-9-29 18:56:54 | 只看该作者 Only view this author
fhh2626 发表于 2022-9-29 12:05
要结合iapbs interface

https://mccammon.ucsd.edu/iapbs/

好的,感谢

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