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[新手求助] Gaussian优化两个分子结合时,优化后两个分子的朝向问题

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楼主
请教老师,同样的两个分子,初始位置保持不变,为什么选择的DFT泛函和基组不同,优化后这两个分子的相对位置和朝向出现了很大的偏差,怎么去挑选这两个不同构型?

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发表于 Post on 2021-3-12 15:32:53 | 只看该作者 Only view this author
不同计算级别下势能面不同,当然可能优化到的极小点构型不同,更何况同一个复合物的不同构型也对应不同极小点,完全可能因为巧合不同级别收敛到不同构型去

当二聚体有多种不同可能的构型时,应当用恰当的计算级别做构型搜索,以得到能量最低构型,怎么做看
使用molclus程序做团簇构型搜索和分子构象搜索
http://bbs.keinsci.com/thread-577-1-1.html
genmer:生成团簇初始构型结合molclus做团簇结构搜索的超便捷工具
http://bbs.keinsci.com/thread-2369-1-1.html

对于某些情况,也可以根据静电势互补原理、范德华势来估计什么样的结合构型可能是能量最低的,参见
静电势与平均局部离子化能相关资料合集
http://bbs.keinsci.com/thread-219-1-1.html
全面探究18碳环独特的分子间相互作用与pi-pi堆积特征
http://sobereva.com/572http://bbs.keinsci.com/thread-19660-1-1.html
静电效应主导了氢气、氮气二聚体的构型
http://sobereva.com/209
谈谈范德华势以及在Multiwfn中的计算、分析和绘制
http://sobereva.com/551http://bbs.keinsci.com/thread-17271-1-1.html

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kkyle + 5 谢谢
yang2020 + 5 谢谢老师的详细解答!

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