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[辅助/分析程序] 请教社长,计算热力学量校正值的shermo程序可以加入校正因子吗?

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本帖最后由 fallleave 于 2019-9-29 10:41 编辑

是改Fortran源码?还是把振动频率分别乘以校正因子后再填进shermo.ini?
谢谢。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-9-29 15:31:49 | 只看该作者 Only view this author
是不是加不加校正因子对最终的热力学量的数据影响很小?

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发表于 Post on 2019-9-30 04:06:18 | 只看该作者 Only view this author
自己手动乘上校正因子再贴到shermo.ini里
影响大不大和具体用的泛函的HF成份以及算的问题有关(不同情况下前后求差产生的抵消程度不同)。若有可能,建议至少考虑ZPE校正因子。但是从实际结果角度讲,就算不考虑校正因子,一般影响也不很明显,懒得乘的话也不是不能接受。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-9-30 08:09:59 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-9-30 04:06
自己手动乘上校正因子再贴到shermo.ini里
影响大不大和具体用的泛函的HF成份以及算的问题有关(不同情况下 ...

感谢社长回复,那么是不是将ZPE的校正因子乘以频率,填入shermo.ini,然后调用shermo.exe计算出校正后的ZPE,再这样分别计算出H和G的校正量,这样算出的ZPE、H和G的校正量才最正确?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-9-30 08:16:38 | 只看该作者 Only view this author
或者按照社长的博文http://sobereva.com/221中的方法,
利用freqchk,就可以反复利用不同校正因子得到较准确的ZPE、ΔH和熵,并获得自由能G=H-T*S,过程在下面说一下。以下是freq任务会输出的四个量,为了省事用字母表示,使用不同校正因子时它们都会有变化。
Zero-point correction= A
Thermal correction to Energy= B
Thermal correction to Enthalpy= C   注意这一项不是ΔH,而是ZPE+ΔH
Thermal correction to Gibbs Free Energy= D
首先,在ZPE校正因子下得到ZPE(即A)。
然后在熵校正因子下得到-T*S(即D-C)。
之后在ΔH校正因子下得到ΔH(即C-A)。
最终将这三个量加在一起,再加上高精度方法算的电子能量E,就得到了自由能G=E+ZPE+ΔH-T*S。

将shermo当做freqchk用,按照上述步骤算出ZPE,ΔH,-T*S?

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发表于 Post on 2019-10-1 07:40:51 | 只看该作者 Only view this author
fallleave 发表于 2019-9-30 08:09
感谢社长回复,那么是不是将ZPE的校正因子乘以频率,填入shermo.ini,然后调用shermo.exe计算出校正后的Z ...

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-10-3 11:16:52 | 只看该作者 Only view this author

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发表于 Post on 2021-3-27 10:20:45 | 只看该作者 Only view this author
老师们,shermo程序怎么下载呢

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发表于 Post on 2021-3-27 10:30:26 | 只看该作者 Only view this author
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发表于 Post on 2021-3-27 10:49:47 | 只看该作者 Only view this author
zhaoyicong 发表于 2021-3-27 10:20
老师们,shermo程序怎么下载呢

Google搜Shermo一开始不就有么
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