计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 11514|回复 Reply: 11
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Gaussian/gview] 计算时使用DMPU溶剂求助

[复制链接 Copy URL]

33

帖子

0

威望

315

eV
积分
348

Level 3 能力者

我在计算一个有机反应,但是实验人用到的溶剂是DMPU,我写了它的名字DMPU(N,N′-dimethylpropyleneurea),但是高斯不识别报错。我去翻看了高斯的说明书,需要自行填写介电常数


我去找了sob大师的帖子,查过试剂网站,但是都没有我要的介电常数,请问有没有人用过这个溶剂,高斯的溶剂模型里应该怎么写呢?我用DMA代替可以嘛?

还有一个疑问:如果自定溶剂的话,是不是用PCM好一点呢?我看说明书里SCRF(SMD,Solvent=Generic,PCM=Read)这行既有SMD,也有PCM是错误的写法嘛?高斯能识别出用哪个嘛?
期待大神回复

1万

帖子

0

威望

9891

eV
积分
22137

Level 6 (一方通行)

2#
发表于 Post on 2021-5-28 17:19:29 | 只看该作者 Only view this author
用谷歌/维基查查试试
SMD和PCM不是互斥的关系,SMD是由静电项和非静电项组成的,前者可以是比如说PCM、CPCM等等。有时会涉及到给SMD的静电项部分指定参数,这时就会出现SMD和PCM都写出来的情况。不代表程序要在SMD和PCM里二选一
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

928

帖子

1

威望

8265

eV
积分
9213

Level 6 (一方通行)

3#
发表于 Post on 2021-5-28 18:21:02 | 只看该作者 Only view this author
你这是啥说明书……官方说明书可没有这种写法

33

帖子

0

威望

315

eV
积分
348

Level 3 能力者

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-5-28 22:06:59 | 只看该作者 Only view this author
hebrewsnabla 发表于 2021-5-28 18:21
你这是啥说明书……官方说明书可没有这种写法

就是g09的说明书啊,就这么写的

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125177

管理员

公社社长

5#
发表于 Post on 2021-5-29 05:38:18 | 只看该作者 Only view this author
怎么正确定义溶剂此文明确说了,没必要看手册
谈谈隐式溶剂模型下溶解自由能和体系自由能的计算
http://sobereva.com/327http://bbs.keinsci.com/thread-3345-1-1.html
没现成介电常数的情况要么凑合猜一个,要么自己做动力学模拟得到,要么用Clausius–Mossotti关系基于极化率凑合估计

如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问,并清楚反映出帖子具体内容,避免有任何歧义,仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题“DMPU溶剂的介电常数”改了,以后务必注意,下次将扣分处理。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

444

帖子

0

威望

2578

eV
积分
3022

Level 5 (御坂)

娃娃儿鱼

6#
发表于 Post on 2021-5-29 09:34:25 | 只看该作者 Only view this author
hebrewsnabla 发表于 2021-5-28 18:21
你这是啥说明书……官方说明书可没有这种写法

某度文库里的广泛传的中文g09手册。。
真·探

928

帖子

1

威望

8265

eV
积分
9213

Level 6 (一方通行)

7#
发表于 Post on 2021-5-29 15:03:09 | 只看该作者 Only view this author
蛋蛋 发表于 2021-5-28 22:06
就是g09的说明书啊,就这么写的

官方说明书没有中文的,你看的这个不可靠。

官方g09说明书可以在http://gaussian.com/g16/g09ur.tgz 下载。看里面scrf章节,没有你贴出的这种写法。

33

帖子

0

威望

315

eV
积分
348

Level 3 能力者

8#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-5-31 17:21:07 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-5-29 05:38
怎么正确定义溶剂此文明确说了,没必要看手册
谈谈隐式溶剂模型下溶解自由能和体系自由能的计算
http://s ...

嗯嗯,我请教过老师,也是找不到参数,决定用DMA替换。谢谢您

33

帖子

0

威望

315

eV
积分
348

Level 3 能力者

9#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-5-31 17:22:20 | 只看该作者 Only view this author
hebrewsnabla 发表于 2021-5-29 15:03
官方说明书没有中文的,你看的这个不可靠。

官方g09说明书可以在http://gaussian.com/g16/g09ur.tgz  ...

我竟然不知道自己看了这么久的说明书是错的 谢谢你,我赶紧去下载收藏

334

帖子

1

威望

6159

eV
积分
6513

Level 6 (一方通行)

10#
发表于 Post on 2021-5-31 18:42:29 | 只看该作者 Only view this author
hebrewsnabla 发表于 2021-5-29 15:03
官方说明书没有中文的,你看的这个不可靠。

官方g09说明书可以在http://gaussian.com/g16/g09ur.tgz  ...

倒也不是什么山寨说明书。他看的这个估计是科大翻译过的那个版本。确实原版的user reference也是有这一段的。
就在您给的这个压缩包里scrf那个  k_scrf.htm 文件里搜索 Additional Input for PCM Calculations  也是可以看得到这部分的。

928

帖子

1

威望

8265

eV
积分
9213

Level 6 (一方通行)

11#
发表于 Post on 2021-6-1 13:17:29 | 只看该作者 Only view this author
paramecium86 发表于 2021-5-31 18:42
倒也不是什么山寨说明书。他看的这个估计是科大翻译过的那个版本。确实原版的user reference也是有这一段 ...

“这一部分”是有,我没说没有,我说的是那一行关键词的写法不同。
也许G09某个早期版本的手册确实是这样,也许翻译的时候抄错了。

334

帖子

1

威望

6159

eV
积分
6513

Level 6 (一方通行)

12#
发表于 Post on 2021-6-1 16:27:37 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 paramecium86 于 2021-6-1 16:34 编辑
hebrewsnabla 发表于 2021-6-1 13:17
“这一部分”是有,我没说没有,我说的是那一行关键词的写法不同。
也许G09某个早期版本的手册确实是这 ...

嗯嗯 是的。应该是较老版本g09 user manual的。我去翻了下之前下载的科大那个翻译版的。sob大神确实给过批注是基于 B01 或者 C01版本的manual. 还看了看以前论坛上下过的 g09 a02的user reference 那里面跟楼主贴出来的这部分关键词写法确实也一样。

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-25 12:51 , Processed in 0.201161 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list