计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 193|回复 Reply: 2
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[综合交流] 金属离子与有机分子形成的螯合物的结合能应该怎么计算

[复制链接 Copy URL]

107

帖子

1

威望

1742

eV
积分
1869

Level 5 (御坂)

黄昏粼粼

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
本帖最后由 pikachuupup 于 2024-9-21 17:10 编辑

请问各位老师,我想计算金属离子与有机分子螯合的过程中的相关能量,于是我想到了结合能。但是在螯合过程中,两分子的有机分子需要先下来四个氢后再与一个金属离子配位,请问:
1、此时是否可以计算螯合物的结合能?
2、螯合过程中,两个有机分子共下来四个氢。此时计算结合能时使用E(A_B_C)-E(A)-E(B)-E(C)+E(BSSE)的公式,A和B(有机分子)是使用一开始的构型还是使用已经下来四个氢后的构型呢?如果使用下来氢之前的构型,那在计算结合能过程中应如何考虑这几个氢?如果使用已经下来氢后的构型,单体A和B是否还需要进行优化?
3、如果此时计算结合能不太合适,那应该考虑什么能量进行计算比较好,是否可以用反应前后的自由能变说明一些问题?
希望老师们不吝赐教,谢谢老师。
愿乘长风,破万里浪

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112492

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2024-9-21 23:15:02 | 只看该作者 Only view this author
得说清楚具体环境,根据化学知识弄清楚下来的四个氢是什么状态(诸如溶剂化质子?)。如果质子是在结合时才掉下来的,应当总产物减去总反应物来算,即掉下来的H也得恰当算进去(并且以实际的形态来算)
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

107

帖子

1

威望

1742

eV
积分
1869

Level 5 (御坂)

黄昏粼粼

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-9-22 09:20:21 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-9-21 23:15
得说清楚具体环境,根据化学知识弄清楚下来的四个氢是什么状态(诸如溶剂化质子?)。如果质子是在结合时才 ...

明白了,谢谢老师~
愿乘长风,破万里浪

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-26 23:14 , Processed in 0.164120 second(s), 21 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list