求问ORCA算单点能报错原因

雪见容馥 · 发表于 Post on 2021-7-27 16:58:31

小白第一次用ORCA算单点能，用Multiwfn构造了输入文件，在64核超算服务器上运行了一会报错，不知道是什么原因？模型图如下图所示，由Ti3C2和碳纳米管组成，已上传输入文件和输出文件，求求大佬指出问题，谢谢

zjxitcc · 发表于 Post on 2021-7-27 17:34:22

减少核数、增大单核内存、用5.0.1版本。届时还有问题再上传输出文件或贴出报错信息

wzkchem5 · 发表于 Post on 2021-7-27 17:52:37

大概率是openmpi安装问题，比如没有装gfortran。参见https://orcaforum.kofo.mpg.de/vi ... t=7566&start=30

雪见容馥 · 发表于 Post on 2021-7-27 19:00:02

zjxitcc 发表于 2021-7-27 17:34
减少核数、增大单核内存、用5.0.1版本。届时还有问题再上传输出文件或贴出报错信息

可是用的超算服务器是64核的，不满核也会满核提交

zjxitcc · 发表于 Post on 2021-7-27 19:05:28

本帖最后由 zjxitcc 于 2021-7-27 19:07 编辑

雪见容馥发表于 2021-7-27 19:00
可是用的超算服务器是64核的，不满核也会满核提交

不会的，队列系统脚本中的核数是申请，而不是一定用那么多，ORCA真正的核数控制在inp文件里。例如你可以申请一台64核的节点，但是只用16核并行算ORCA，这样在你算的时候别人无法蹭你的机器，队列系统不会再分配任务到此节点上。另外，按照楼上说的检查一下有无gfortran，或者是否加载了gfortran环境变量。

雪见容馥 · 发表于 Post on 2021-7-27 19:07:06

本帖最后由雪见容馥于 2021-7-27 19:09 编辑

wzkchem5 发表于 2021-7-27 17:52
大概率是openmpi安装问题，比如没有装gfortran。参见https://orcaforum.kofo.mpg.de/viewtopic.php?f=9&t=7 ...

小白不是很懂，我是上传安装包到超算平台上，管理员帮我装的，点开链接没有看到gfortran的下载，换成5.0.1能解决这个问题吗

zjxitcc · 发表于 Post on 2021-7-27 19:07:50

雪见容馥发表于 2021-7-27 19:07
小白不是很懂，我是上传安装包到超算平台上，管理员帮我装的，点开链接没有看到gfortran的下载

你问管理员就行了，自己不会就不要操作。不过新手小白算这种体系，下一个问题就是SCF不收敛了。。。

雪见容馥 · 发表于 Post on 2021-7-27 19:11:11

zjxitcc 发表于 2021-7-27 19:07
你问管理员就行了，自己不会就不要操作。不过新手小白算这种体系，下一个问题就是SCF不收敛了。。。

麻烦问一下这种体系用什么软件算比较好？我用gaussian跑不动才换的ORCA

wzkchem5 · 发表于 Post on 2021-7-27 20:14:47

雪见容馥发表于 2021-7-27 12:07
小白不是很懂，我是上传安装包到超算平台上，管理员帮我装的，点开链接没有看到gfortran的下载，换成5.0. ...

你告诉管理员orca需要装最新版openmpi了吗？openmpi是在orca安装包之外，需要单独去获取、编译的

zjxitcc · 发表于 Post on 2021-7-27 21:14:04

本帖最后由 zjxitcc 于 2021-7-27 21:16 编辑

雪见容馥发表于 2021-7-27 19:11
麻烦问一下这种体系用什么软件算比较好？我用gaussian跑不动才换的ORCA

如果你的Ti3C2建模合适，该体系确实不小，适合用ORCA跑。ORCA 5需要搭配openmpi-4.1.1使用，你需要告诉管理员这个。一个个问题解决，每解决完一个，还有问题再贴出来。新手的问题可能有一堆，先把能确定弄成的给搞定掉。如果你的集群管理员也不是很懂，你们俩可以看《ORCA 5.0安装及运行》

雪见容馥 · 发表于 Post on 2021-7-27 21:38:04

wzkchem5 发表于 2021-7-27 20:14
你告诉管理员orca需要装最新版openmpi了吗？openmpi是在orca安装包之外，需要单独去获取、编译的

好的，谢谢老师

雪见容馥 · 发表于 Post on 2021-7-27 21:38:41

zjxitcc 发表于 2021-7-27 21:14
如果你的Ti3C2建模合适，该体系确实不小，适合用ORCA跑。ORCA 5需要搭配openmpi-4.1.1使用，你需要告诉管 ...

好的，谢谢老师

雪见容馥 · 发表于 Post on 2021-7-28 10:38:10

zjxitcc 发表于 2021-7-27 21:14
如果你的Ti3C2建模合适，该体系确实不小，适合用ORCA跑。ORCA 5需要搭配openmpi-4.1.1使用，你需要告诉管 ...

老师，麻烦问一下这个算例是不是用256GB的内存不太够啊，才运行没几分钟就内存溢出了，是设置的问题吗

winnerwill · 发表于 Post on 2021-7-28 10:45:51

雪见容馥发表于 2021-7-28 10:38
老师，麻烦问一下这个算例是不是用256GB的内存不太够啊，才运行没几分钟就内存溢出了，是设置的问题吗

单核内存设到20GB以上试试

zjxitcc · 发表于 Post on 2021-7-28 11:40:38

雪见容馥发表于 2021-7-28 10:38
老师，麻烦问一下这个算例是不是用256GB的内存不太够啊，才运行没几分钟就内存溢出了，是设置的问题吗

由于你是新手，为免你判断失误，说“内存溢出”时应该贴出报错截图，让大家分析一下。另外，我早在2L就回复过了“减少核数、增大单核内存”，你没注意看。

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