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[综合交流] 质子转移做柔性扫描能量一直上升是否可以说明不存在过渡态

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各位老师好,我在找一个质子转移的过渡态,反应物如图所示,产物是44号H连到59号O上,换了多个初猜都没有找到,于是就对59和44这两个原子做了键长的柔性扫描,发现能量随着两原子之间距离的缩短是逐步上升的,那我便以为这个反应的逆反应是无能垒反应,我对产物进行柔性扫描,即初始结构44号H接在59号O上,然后对44号H和43号O做柔性扫描,发现能量也是随着距离的缩短逐步上升,也就是说H无论是脱离59号O去和43号O结合,还是脱离43号O去和59号O结合都是不利的。
想问一下为何会出现这种情况,这说明H转移是十分困难的吗?




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发表于 Post on 2024-6-13 15:13:12 | 只看该作者 Only view this author
请问楼主找到原因了吗?我目前也遇到了这个问题

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-6-15 16:38:29 | 只看该作者 Only view this author
candicechen 发表于 2024-6-13 15:13
请问楼主找到原因了吗?我目前也遇到了这个问题

目前过渡态一直没找大,你可以用跑个AIMD看一下

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发表于 Post on 2024-6-15 17:00:45 | 只看该作者 Only view this author
只要扫描范围足够宽,扫描步长足够小,发现能量单调变化,就说明是无垒反应。
逆反应是无垒反应并不一定说明反应困难,要判断反应是否困难,仍然需要计算活化Gibbs自由能,为求准确可以用比如说Baik的方法(http://dx.doi.org/10.1021/acs.organomet.8b00456)。不同方法(直接取Gibbs自由能变;Baik法;VRC-TST;AIMD)的优劣,我之前在论坛上总结过,很容易搜到
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

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