计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 5463|回复 Reply: 4
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[新手求助] DFT计算能量精度问题咨询

[复制链接 Copy URL]

7

帖子

0

威望

353

eV
积分
360

Level 3 能力者

咨询一下各位老师,我用DFTTD-DFT计算有机分子(30-40个原子左右)的结构、能量以及发光性质等等。
审稿人提问了一个如下的问题:
The chemicalaccuracy is generally 1kcal/mol and common DFT calculations cannot achieve thisaccuracy, so it is necessary for the authors to standardize the effectivenumber of energy in the paper.
咨询一下老师,从哪几个方面回复呢?需要换高精度的方法重新优化分子结构,计算能量?如果这样的话,文章里面所有的数据几乎都要重算吧。用啥方法计算呢?或者是从其他方面如何来回复审稿人的问题呢?
谢谢各位老师的指导。

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125141

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2021-11-14 20:47:24 | 只看该作者 Only view this author
看清楚板块再发贴!学术求助帖不得发到公社大厅板块,版头都用超级巨大的红字明确写明了还看不见?这次给你移动了,下次再发错直接删帖+扰乱论坛秩序扣分处理


北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125141

管理员

公社社长

3#
发表于 Post on 2021-11-14 21:01:50 | 只看该作者 Only view this author
审稿人没直接质疑你计算精度,说的是文中的能量的有效数字。
我不知道你的文章里对能量数据用的什么单位、保留的几位小数。DFT精度的水准,以kJ/mol或kcal/mol为单位时通常应当按照习俗保留一位小数。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

108

帖子

0

威望

3260

eV
积分
3368

Level 5 (御坂)

4#
发表于 Post on 2021-11-14 21:13:18 | 只看该作者 Only view this author
没做过激发态的计算,只做过基态计算。我一般都是m062x/def2tzvp优化,基于此结构用热力学组合方法或者ORCA的DLPNO-ccsd(t)算一下高精度能量。30个原子误差达到化学精度还是有困难的,我用cbs-qb3算20个原子左右都费劲。也可以尝试DLPNO-ccsd(t)的热力学组合方法,如DLPNO-ccsd(t)//b3lyp-d3(bj) [JPCA, 121, 4379(2017)]

1万

帖子

0

威望

9859

eV
积分
22096

Level 6 (一方通行)

5#
发表于 Post on 2021-11-14 21:19:41 | 只看该作者 Only view this author
这个审稿人英文不好,把有效数字直译成effective number了,所以可能让人反应不过来,应该说significant figures/significant digits

评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +3 收起 理由
Reason
LittlePupil + 3 不明觉厉

查看全部评分 View all ratings

Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-21 02:42 , Processed in 0.204210 second(s), 24 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list