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[波函数分析求助] 局部软度值可以比较复杂化合物之间的活性吗?

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我想请问一下:该令福井函数乘上全局软度,就得到了局部软度函数,然后以不同方式空间划分(如Hirshfeld、Becke)可以得到每个原子的局部软度值,然后比较不同金属原子的这个值。这个公式可以比较复杂化合物之间的活性吗?不仅仅是金属元素。
打扰您了,希望您抽空帮忙解答一下

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发表于 Post on 2020-3-22 14:09:56 | 只看该作者 Only view this author
如置顶的新社员必读贴和论坛首页的公告栏所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出“提问”、“求助”要素及具体内容(仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html),我已把你的不恰当标题“化合物活性”改了,以后务必注意
此类问题属于波函数分析问题,不要发到量子化学版,给你移动了
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2020-3-22 14:12:43 | 只看该作者 Only view this author
复杂化合物需要说得更具体。本来这就不限于金属元素,反倒是用于主族元素用得更多

没有其它额外信息的话,而且相互比较的体系比较类似,可以拿这个来试图预测局部活性。但如果和诸如计算的势垒、实验反应速率/位点不符,就不要强行拿这个说事
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-3-23 13:36:26 | 只看该作者 Only view this author
谢谢老师,我以后注意问题的分类,但是我想知道这个计算方法可以用于相同条件下,不同化合物之间活性比较吗?希望老师可以给一个明确的回答,辛苦老师了

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发表于 Post on 2020-3-25 22:04:22 | 只看该作者 Only view this author
Alisa 发表于 2020-3-23 13:36
谢谢老师,我以后注意问题的分类,但是我想知道这个计算方法可以用于相同条件下,不同化合物之间活性比较吗 ...

化合物特征相差太大就不行
起码也得主体结构相同
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-3-26 19:01:22 | 只看该作者 Only view this author
谢谢老师,懂得了

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-3-26 21:00:39 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-3-25 22:04
化合物特征相差太大就不行
起码也得主体结构相同

谢谢老师的解答,我还有个问题就是已知该化合物的结构式,怎么计算该化合物的福井函数和软度值,麻烦老师了,希望老师可以给出详细的解答,辛苦老师了

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发表于 Post on 2020-3-28 05:25:13 | 只看该作者 Only view this author
Alisa 发表于 2020-3-26 21:00
谢谢老师的解答,我还有个问题就是已知该化合物的结构式,怎么计算该化合物的福井函数和软度值,麻烦老师 ...

用量子化学程序先优化结构,然后用Multiwfn计算,看下文
使用Multiwfn超级方便地计算出概念密度泛函理论中定义的各种量
http://sobereva.com/484http://bbs.keinsci.com/thread-13328-1-1.html

如果体系可能的构象很多,应当先用molclus(http://www.keinsci.com/research/molclus.html)做构象搜索,找到能量最低构象再做如上计算

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发表于 Post on 2021-9-24 20:40:53 | 只看该作者 Only view this author
老师,我想问一下,倒数第三行的软度值与不同原子的局部软度是一个什么样的关系?最后我用高斯计算的HOMO-LUMO gap与这样一个输出结果差别挺大是什么原因?

202109242038405270..png (35.32 KB, 下载次数 Times of downloads: 29)

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发表于 Post on 2021-9-29 16:03:17 | 只看该作者 Only view this author
yinlina 发表于 2021-9-24 20:40
老师,我想问一下,倒数第三行的软度值与不同原子的局部软度是一个什么样的关系?最后我用高斯计算的HOMO-L ...

局部软度=软度*简缩福井函数
这点在Multiwfn手册3.25.1节明确说了

本来软度和HOMO-LUMO gap就没很好的相关性,既然你都能算物理意义严格得多的软度了,再拿HOMO-LUMO gap讨论反应性根本就没意义了
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