计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 2894|回复 Reply: 6
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Gaussian/gview] Scan后做频率分析没有虚频

[复制链接 Copy URL]

25

帖子

0

威望

95

eV
积分
120

Level 2 能力者

本帖最后由 gnli 于 2022-4-15 23:00 编辑

大家好 我想找C=O加氢反应的过渡态(金属中心的氢原子加到C上,N上的氢加到O上)
1.先扫描了C-H键的距离,得到了如下扫描曲线。
2.然后取能量最高点做频率计算,却没有虚频。
3.然后又在峰附近用很小的步长继续做了一个scan 但是峰值附近的结构还是没有虚频。做了Mn和Fe两个金属的计算,其他计算也是同样方法,频率计算都正常。
比较了这个结构和其他几个的结构,键长非常接近。所以很纳闷。
请问这种情况原因是什么,求大神指点。


Scan.png (182.61 KB, 下载次数 Times of downloads: 12)

Scan结果

Scan结果

3808

帖子

4

威望

8000

eV
积分
11888

Level 6 (一方通行)

MOKIT开发者

2#
发表于 Post on 2022-4-15 23:25:55 | 只看该作者 Only view this author
(1)先确认是否波函数是否稳定、过渡金属上的自旋布居是否符合期望,以免收敛到了错误的波函数解上;
(2)柔性扫描最高点通常是合理的过渡态初始结构,做freq有个明显虚频,但这是经验规则,不是物理定律,少数体系违背经验规则是可以的。
自动做多参考态计算的程序MOKIT

25

帖子

0

威望

95

eV
积分
120

Level 2 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-4-16 00:03:29 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2022-4-15 23:25
(1)先确认是否波函数是否稳定、过渡金属上的自旋布居是否符合期望,以免收敛到了错误的波函数解上;
(2 ...

做了scan峰值处结构的波函数稳定性测试:
#p stable 6-311+g(d,p) empiricaldispersion=gd3bj pbe1pbe
结果显示:“The wavefunction is stable under the perturbations considered.”

那请问出现这种非经验情况,应该怎么找到过渡态呢?

269

帖子

0

威望

1758

eV
积分
2027

Level 5 (御坂)

4#
发表于 Post on 2022-4-16 11:09:31 | 只看该作者 Only view this author
这个协同反应的反应物和过渡态“没有局部带显著负电荷”(http://sobereva.com/119),是否需要去掉弥散函数试一下?

25

帖子

0

威望

95

eV
积分
120

Level 2 能力者

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-4-16 17:20:46 | 只看该作者 Only view this author
dnlx 发表于 2022-4-16 11:09
这个协同反应的反应物和过渡态“没有局部带显著负电荷”(http://sobereva.com/119),是否需要去掉弥散函 ...

不加弥散也不行,还是没有虚频

269

帖子

0

威望

1758

eV
积分
2027

Level 5 (御坂)

6#
发表于 Post on 2022-4-16 19:13:14 | 只看该作者 Only view this author
gnli 发表于 2022-4-16 17:20
不加弥散也不行,还是没有虚频

如果是我的话,只能改用ORCA的NEB-TS去寻找过渡态。

25

帖子

0

威望

95

eV
积分
120

Level 2 能力者

7#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-4-17 02:41:08 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 gnli 于 2022-4-17 02:43 编辑

ORCA的话还得现学个软件。。。用 opt=(ts,calcfc,noeigen)的话总是跑回反应物了
我现在把scan导出来的结构用最慢的opt=(ts,calcall,noeigen) 继续优化看看情况

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-25 15:35 , Processed in 0.574555 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list