高斯多步任务计算，去除冗余坐标续算上一任务的结构求助

lpy-lzu · 发表于 Post on 2021-10-28 16:26:46

高斯多步任务计算，可以使用软件自带的link1功能，实现对同一结构或不同结构的批处理
在计算过渡态时，通常会使用freeze冻结成键或断键，然后再进行opt+freq
能否可以通过高斯link1多步任务计算，在一个gjf文件中完成这一作业？
设想是首先第一个作业计算freeze，第二个作业去除冗余坐标后，用geom=check，guess=read对结构进行优化加频率计算，第三个作业进行大基组单点计算。
但高斯手册中link1功能这一部分没有提及如何去除冗余坐标，希望老师解答

已经尝试过，在第二个作业中直接用geom=check，guess=read，并没有去除冗余坐标，很显然和预期一样，并没有奇迹的自动去除...

zjxitcc · 发表于 Post on 2021-10-28 16:33:27

本帖最后由 zjxitcc 于 2021-10-28 16:36 编辑

假设你用了opt=modredundant进行坐标限制，下一步可以这么写
--Link1--
#p opt freq 方法 chkbasis guess=read geom(allcheck,NewRedundant) #读取电荷、自旋多重度和坐标，并去除坐标限制

niobium · 发表于 Post on 2021-10-28 16:35:08

geom=newdefinition试试

lpy-lzu · 发表于 Post on 2021-10-28 16:38:46

ok，感谢两位，我试试这两个关键词，有用回来说

lpy-lzu · 发表于 Post on 2021-10-28 16:54:41

geom=newdefinition和geom=newredundant这两个关键词都有用，
刚查了高斯手册
geom=newredundant的作用是Rebuilds the redundant internal coordinates from the current Cartesian coordinates.
geom=newdefinition的作用是Generate a new set of redundant internal coordinates, replacing any that were in the checkpoint file.
从这个问题的作用上看，区别不大，我的理解是一个是从当前的笛卡尔坐标中改，一个是从check文件中修改
再次感谢两位老师

sobereva · 发表于 Post on 2021-10-29 06:10:48

opt里写nofreeze也可以，将之前冻结的坐标都解冻

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[Gaussian/gview] 高斯多步任务计算，去除冗余坐标续算上一任务的结构求助