Gaussian优化出错退出

曾yw

       各位老师好：本人优化该分子出错，请各位老师看看是什么原因。万分感谢（新手小白）


输入文件请见附件


输出文件： gptms-TEOS-REACTION.rar (109.89 KB, 下载次数 Times of downloads: 2)

2021-11-1 10:51 上传 Uploaded

点击下载
Click to download
输出文件

输入文件： gptms-TEOS-REACTION.gjf (9.26 KB, 下载次数 Times of downloads: 5)

2021-11-1 10:49 上传 Uploaded

点击下载
Click to download
输入文件

以下为部分输出文件：

GradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGrad

Stoichiometry    C24H65O32Si8(2)
Framework group  C1[X(C24H65O32Si8)]
Deg. of freedom   381
Full point group                 C1      NOp   1
Largest Abelian subgroup         C1      NOp   1
Largest concise Abelian subgroup C1      NOp   1
                         Standard orientation:                        
---------------------------------------------------------------------
Center     Atomic      Atomic             Coordinates (Angstroms)
Number     Number       Type             X           Y           Z
---------------------------------------------------------------------
      1          8           0      -11.345815   -5.408407   -0.862309
      2          1           0      -11.125195   -4.916052   -1.701824
      3          6           0      -10.123674   -5.992028   -0.245723
      4          1           0      -10.483289   -6.649004    0.574603
      5          1           0       -9.572295   -6.607840   -1.007779
      6          6           0       -9.174690   -4.942273    0.306220
      7          1           0       -9.737055   -4.273049    1.014589
      8          8           0       -8.718878   -4.158853   -0.876201
      9          1           0       -7.932095   -3.582404   -0.653906
     10          6           0       -7.995319   -5.548544    1.051606
     11          1           0       -8.352579   -6.181918    1.912049
     12          1           0       -7.383504   -6.189010    0.353262
     13          8           0       -7.186351   -4.391215    1.533323
     14          6           0       -6.076664   -4.628588    2.506380
     15          1           0       -6.503885   -5.032093    3.469264
     16          1           0       -5.352398   -5.385178    2.086136
     17          6           0       -5.366737   -3.302308    2.757171
     18          1           0       -4.942020   -2.934510    1.787381
     19          1           0       -6.120580   -2.559551    3.125133
     20          6           0       -4.222531   -3.486217    3.819904
     21          1           0       -3.467275   -4.229543    3.457333
     22          1           0       -4.647885   -3.837661    4.794683
     23         14           0       -3.312666   -1.904233    4.164666
     24          8           0       -2.096321   -2.147864    5.342543
     25          1           0       -1.504429   -1.395777    5.662024
     26          8           0       -4.381766   -0.714051    4.732427
     27          1           0       -3.996336    0.188980    4.971132
     28          8           0       -2.590158   -1.293855    2.679401
     29         14           0       -1.286320   -0.293866    2.578032
     30          8           0        0.124819   -1.301772    2.872067
     31          8           0       -1.622765    0.676339    3.863974
     32          1           0       -1.212710    1.577592    3.823229
     33          8           0       -1.176306    0.217634    0.821608
     34         14           0        1.673534   -1.015947    2.205507
     35          1           0        1.120869   -1.229812    0.602686
     36         14           0       -0.214100    1.222616   -0.243579
     37          8           0        3.083674   -1.959516    2.371246
     38          8           0        2.067375    0.495035    2.660804
     39         14           0        3.346457    1.536319    2.729073
     40          8           0        4.527608    0.753733    3.676478
     41          1           0        5.298073    1.328947    3.966311
     42          8           0        3.753289    1.794654    1.077060
     43          1           0        4.242863    2.643918    0.861441
     44          6           0        2.976475    3.251861    3.456713
     45          1           0        3.967476    3.779896    3.500202
     46          1           0        2.602286    3.083923    4.497380
     47          6           0        1.957689    4.157659    2.651036
     48          1           0        0.931509    3.951263    2.995804
     49          1           0        2.009940    3.956470    1.549715
     50          6           0        2.257464    5.638349    2.869572
     51          1           0        2.274112    5.871693    3.975582
     52          1           0        3.262617    5.906505    2.429465
     53          8           0        1.183839    6.434362    2.200753
     54          6           0        1.269689    7.916920    2.252974
     55          1           0        2.211655    8.271946    1.743956
     56          1           0        1.272996    8.262192    3.326610
     57          6           0        0.061014    8.496844    1.554509
     58          1           0       -0.873147    8.143573    2.072006
     59          8           0        0.044551    8.019781    0.139480
     60          1           0       -0.365000    8.697187   -0.473495
     61          6           0        0.111484   10.011832    1.602635
     62          1           0        0.161190   10.371061    2.665279
     63          1           0        1.018358   10.380810    1.048587
     64          8           0       -1.146210   10.443262    0.919448
     65          1           0       -1.283690   11.429406    0.920560
     66         14           0        4.315230   -1.746161    1.189542
     67          8           0        5.655979   -1.120554    1.958939
     68          1           0        6.499045   -1.701795    1.930680
     69          8           0        4.785552   -3.325875    0.728034
     70          8           0        3.777540   -0.903004   -0.096997
     71          1           0        3.950297   -1.286814   -1.003904
     72         14           0        6.192691   -3.882269   -0.103278
     73          8           0        7.439590   -3.425952    0.984059
     74          1           0        8.159375   -4.078092    1.234108
     75          8           0        6.025531   -5.568911   -0.128711
     76          1           0        6.776995   -6.106925   -0.522684
     77          6           0        6.534238   -3.204612   -1.845605
     78          1           0        5.555072   -3.027232   -2.358355
     79          1           0        7.091032   -2.240757   -1.736640
     80          6           0        7.380881   -4.181431   -2.733092
     81          1           0        6.776925   -5.095331   -2.972779
     82          1           0        8.316163   -4.487464   -2.192086
     83          6           0        7.806187   -3.528701   -4.054943
     84          1           0        6.902185   -3.133124   -4.594886
     85          1           0        8.306238   -4.292831   -4.706149
     86          8           0        8.739511   -2.384577   -3.770413
     87          6           0       10.035307   -2.217834   -4.494335
     88          1           0        9.852300   -2.007534   -5.578340
     89          1           0       10.642897   -3.161234   -4.393128
     90          6           0       10.830107   -1.065735   -3.880228
     91          1           0       11.814592   -1.041139   -4.417196
     92          8           0       11.044200   -1.389731   -2.426635
     93          1           0       11.998820   -1.484818   -2.162995
     94          6           0       10.216320    0.402951   -3.923399
     95          1           0        9.724978    0.571715   -2.941432
     96          1           0       11.061804    1.130638   -4.045194
     97          8           0        9.200382    0.791090   -4.956079
     98          1           0        9.600278    1.166579   -5.787586
     99          8           0        1.097131    0.052731   -0.193553
    100          8           0       -0.600232    1.664269   -1.808663
    101          8           0       -0.460489    2.775559    0.340477
    102          1           0       -1.285762    3.108616   -0.142722
    103         14           0       -1.753630    1.093109   -2.983887
    104          8           0       -1.160235    1.732699   -4.446756
    105          1           0       -1.708928    1.551507   -5.268925
    106          8           0       -1.529009   -0.598008   -3.017015
    107          1           0       -1.698544   -1.077891   -3.882693
    108          6           0       -3.566438    1.631636   -2.664191
    109          1           0       -3.503183    2.429770   -1.882019
    110          1           0       -3.903253    2.092154   -3.623014
    111          6           0       -4.638059    0.508859   -2.217061
    112          1           0       -4.127950   -0.448367   -1.986742
    113          1           0       -5.139276    0.876522   -1.289529
    114          6           0       -5.761591    0.172440   -3.238029
    115          1           0       -6.001180   -0.932046   -3.227957
    116          1           0       -5.468636    0.447640   -4.270340
    117          8           0       -6.997778    0.945206   -2.824771
    118          6           0       -8.245836    1.164355   -3.643329
    119          1           0       -8.559553    0.176009   -4.081493
    120          1           0       -8.984712    1.482660   -2.870745
    121          6           0       -8.263594    2.222218   -4.787288
    122          1           0       -7.614918    3.084132   -4.483114
    123          8           0       -7.732216    1.673057   -6.087687
    124          1           0       -8.358752    1.788828   -6.858241
    125          6           0       -9.692563    2.704026   -4.996266
    126          1           0      -10.078466    3.168972   -4.051346
    127          1           0      -10.353990    1.834169   -5.272315
    128          8           0       -9.625945    3.692029   -6.116735
    129          1           0      -10.512929    4.073138   -6.362860
---------------------------------------------------------------------
Rotational constants (GHZ):      0.0213789      0.0114466      0.0102827
Standard basis: 6-31+G (6D, 7F)
There are   994 symmetry adapted cartesian basis functions of A   symmetry.
There are   994 symmetry adapted basis functions of A   symmetry.
   994 basis functions,  2116 primitive gaussians,   994 cartesian basis functions
   289 alpha electrons      288 beta electrons
       nuclear repulsion energy     12739.4855435348 Hartrees.
NAtoms=  129 NActive=  129 NUniq=  129 SFac= 1.00D+00 NAtFMM=   60 NAOKFM=T Big=T
Integral buffers will be    262144 words long.
Raffenetti 2 integral format.
Two-electron integral symmetry is turned on.
------------------------------------------------------------------------------
Polarizable Continuum Model (PCM)
=================================
Model                : PCM (using non-symmetric T matrix).
Atomic radii         : UFF (Universal Force Field).
Polarization charges : Total charges.
Charge compensation  : None.
Solution method      : On-the-fly selection.
Cavity type          : Scaled VdW (van der Waals Surface) (Alpha=1.100).
Cavity algorithm     : GePol (No added spheres)
                        Default sphere list used, NSphG=  129.
                        Lebedev-Laikov grids with approx.  5.0 points / Ang**2.
                        Smoothing algorithm: Karplus/York (Gamma=1.0000).
                        Polarization charges: spherical gaussians, with
                                              point-specific exponents (IZeta= 3).
                        Self-potential: point-specific (ISelfS= 7).
                        Self-field    : sphere-specific E.n sum rule (ISelfD= 2).
1st derivatives      : Analytical E(r).r(x)/FMM algorithm (CHGder, D1EAlg=3).
                        Cavity 1st derivative terms included.
Solvent              : Water, Eps=  78.355300 Eps(inf)=   1.777849
------------------------------------------------------------------------------
One-electron integrals computed using PRISM.
NBasis=   994 RedAO= T EigKep=  8.99D-06  NBF=   994
NBsUse=   994 1.00D-06 EigRej= -1.00D+00 NBFU=   994
Initial guess from the checkpoint file:  "C:\Gaussian file\SHI\G-T-REACTION.chk"
B after Tr=     0.000000    0.000000    0.000000
         Rot=    0.980578    0.172680   -0.014743   -0.091818 Ang=  22.62 deg.
Initial guess <Sx>= 0.0000 <Sy>= 0.0000 <Sz>= 0.5000 <S**2>= 0.7564 S= 0.5032
ExpMin= 3.31D-02 ExpMax= 1.61D+04 ExpMxC= 2.43D+03 IAcc=3 IRadAn=         5 AccDes= 0.00D+00
Harris functional with IExCor=  402 and IRadAn=       5 diagonalized for initial guess.
HarFok:  IExCor=  402 AccDes= 0.00D+00 IRadAn=         5 IDoV= 1 UseB2=F ITyADJ=14
ICtDFT=  3500011 ScaDFX=  1.000000  1.000000  1.000000  1.000000
FoFCou: FMM=F IPFlag=           0 FMFlag=      100000 FMFlg1=        2001
         NFxFlg=           0 DoJE=T BraDBF=F KetDBF=T FulRan=T
         wScrn=  0.000000 ICntrl=     500 IOpCl=  0 I1Cent=   200000004 NGrid=           0
         NMat0=    1 NMatS0=      1 NMatT0=    0 NMatD0=    1 NMtDS0=    0 NMtDT0=    0
Petite list used in FoFCou.

zjxitcc

先别管报错。存在大量问题：
（1）结构不合理。结构似乎是你自己构建的，有一对O-O键长过短，如果你是新手，面对这么复杂的结构，最好的办法是去前人文献里找相同、类似的结构，或去晶体库里找现成结构进行合理的截取。

（2）你这文件写着中性、二重态（即自由基），而看结构像常规有机结构，不太可能是自由基。是/否自由基 在计算量上相差很多，算出来性质也差别很大。不要盲目相信GaussView判断的电荷和自旋多重度。如果你不清楚自己在算什么，应立即请教实验室师兄。

（3）基组完全不合理，这文件算出来也没用。看《谈谈量子化学中基组的选择》http://sobereva.com/336
估计你也不知道要加色散校正，看这篇《谈谈“计算时是否需要加DFT-D3色散校正？”》http://sobereva.com/413

（4）这么大的文件才给1GB内存，这就像小刀割麦田，刀断了也是正常的。如果你是囿于Win版Gaussian只能用1.4GB内存，应该立即改用Linux g16，效率高计算快，节约时间，时间=生命。如果你觉得自己不会装linux系统，这也很简单，直接在Win10下安装WSL就可以同时使用两个系统了，然后在WSL里使用Linux g16。

（5）geom=conn和坐标底下的连接关系可以删去，量子化学计算不依赖于这些没用的东西，只会增加文件大小。

tiandikuoyuan

结构构建错了，O上少了个氢原子。这种结构有chemdraw数据的话，直接用chemdraw3D打开应该能生成比较好的初始结构。

曾yw

非常感谢老师的指点，我会认真看相关内容。

wzkchem5

曾yw 发表于 2021-11-1 05:16
非常感谢老师的指点，我会认真看相关内容。

另外，如果是gaussview直接画的结构，除非是很小的分子（十几个原子以内），否则建议先用PM6或者UFF优化，再做DFT计算，不然白白浪费DFT计算时间不说，还会增加SCF不收敛的概率

曾yw

wzkchem5 发表于 2021-11-1 15:59
另外，如果是gaussview直接画的结构，除非是很小的分子（十几个原子以内），否则建议先用PM6或者UFF优化 ...

非常感谢老师的指点