genmer生成xyz文件后调用Gaussian无法打开molclus

zhuyk · 发表于 Post on 2021-12-1 09:20:44

本帖最后由 zhuyk 于 2021-12-1 09:21 编辑

所有参数已经根据帖子里进行了设置，在添加环境变量后出现了几个新的文件，如图3所示，删除不掉。同时molclus闪退，重启后可以打开molclus，但是无法运行高斯软件。之前把路径设置成g09w.exe没有出现这类问题，但是根据之前帖子的问题进行了更改成g09.exe后就出现了无法直接运行高斯的问题

Akaiconan · 发表于 Post on 2021-12-2 08:29:01

本帖最后由 Akaiconan 于 2021-12-2 08:56 编辑

仔细社长的帖子，需要把路径设置到g09.exe结束，设置成g09w.exe打开molclus只会打开高斯软件，不会进行计算。我的理解是molclus是后台运行的，你关闭它的cmd界面它还是在后台运行。
要想关闭molclus，打开任务管理器，进程中你就能看见某一个link（如l502）正在运行，kill掉这个进程，才算把molclus彻底关闭。然后所有gau和gxx开头的文件就能删掉。

zhuyk · 发表于 Post on 2021-12-2 11:44:52

Akaiconan 发表于 2021-12-2 08:29
仔细社长的帖子，需要把路径设置到g09.exe结束，设置成g09w.exe打开molclus只会打开高斯软件，不会进行计算 ...

我现在一直显示的运行，已经运行了一整天了，然后不断生成chk文件，请问下这种状态是还没结束计算吗，然后isomers一直没有数据

Akaiconan · 发表于 Post on 2021-12-2 15:50:57

zhuyk 发表于 2021-12-2 11:44
我现在一直显示的运行，已经运行了一整天了，然后不断生成chk文件，请问下这种状态是还没结束计算吗，然 ...

那你把路径改成g09.exe了吗？cmd窗口中结构一个接着一个开始计算了吗？
我师妹可能遇到了和你类似的问题。她当时的路径也是g09w.exe，molclus一直停在第一个结构。改成g09.exe很快就算完了。轨迹也存在了isomers.xyz中了。
至于chk文件，我看你的ibkchk设定为0，应该会自动删除才对。

zhuyk · 发表于 Post on 2021-12-2 16:10:41

Akaiconan 发表于 2021-12-2 15:50
那你把路径改成g09.exe了吗？cmd窗口中结构一个接着一个开始计算了吗？
我师妹可能遇到了和你类似的问题 ...

已经设置成g09.exe了，然后cmd一直显示的running，生成的文件不断更新，但是isomer一直没有数据出现

sobereva · 发表于 Post on 2021-12-3 03:45:12

zhuyk 发表于 2021-12-2 11:44
我现在一直显示的运行，已经运行了一整天了，然后不断生成chk文件，请问下这种状态是还没结束计算吗，然 ...

谁也没法猜。仔细看屏幕的提示判断，看不懂就截图

明摆着不可能设成g09w.exe，不要做毫无意义的事。此文红字都写得超级清楚了
使用molclus程序做团簇构型搜索和分子构象搜索
http://bbs.keinsci.com/thread-577-1-1.html

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