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[新手求助] 求助:如何利用数值来确定振动模

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大家好,请教大家一个问题,我用Gaussian算了一个体系的频率,该体系构建了两种模型,这两种模型一个在1.48THz处有个振动模,一个在1.51THz处有个振动模,实验在1.48THz处有个振动模,虽然已经比较确定两种模型在这个位置是同一个振动模,但是还是想确定一下(因为我还有用VASP算的)这两个振动模是不是同一个,但从振动模可视化看不出来,因为建的模型不一样,分子个数不一样,所以请教一下大家有没有人了解用数值来判断的

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发表于 Post on 2022-3-2 21:21:23 | 只看该作者 Only view this author
没有“振动模”这种词,那叫振动模式
模=norm
模式=mode

原理上不可能通过Gaussian等量化程序通过簇模型可靠地算周期性体系的振动模式和振动频率,和CP2K、Crystal等第一性原理程序对周期性体系做振动分析也缺乏可比性。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-3-2 21:32:08 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-3-2 21:21
没有“振动模”这种词,那叫振动模式
模=norm
模式=mode

好的老师,那可不可以通过数值的方法来判断振动模式一样不一样呢

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发表于 Post on 2022-3-2 21:51:38 | 只看该作者 Only view this author
wangy0822 发表于 2022-3-2 21:32
好的老师,那可不可以通过数值的方法来判断振动模式一样不一样呢

数值的方法”语义不明原理上就没法判断
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2022-3-3 00:00:16 | 只看该作者 Only view this author
wangy0822 发表于 2022-3-2 14:32
好的老师,那可不可以通过数值的方法来判断振动模式一样不一样呢

但凡判断振动模式一样不一样的方法,必定是数值方法。不仅如此,但凡你做量化计算,都属于数值方法的范畴。所以答案是“可以”,但是我觉得这个答案对你没用,估计你指的数值和我们指的数值不是一个意思
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
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ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
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发表于 Post on 2022-3-3 07:30:31 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-3-3 00:00
但凡判断振动模式一样不一样的方法,必定是数值方法。不仅如此,但凡你做量化计算,都属于数值方法的范畴 ...

我猜:“数值”->“定量”,即有没有定量的描述符能够描述两者异同。
日常打哑谜&&探寻更多可能。
原理问题不公开讨论,非商业性质讨论欢迎私聊。不做培*,不接代*,不接*发谢谢。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-3-10 08:57:53 | 只看该作者 Only view this author
不好意思。可能我没有说清楚问题,举个例子吧,下面的两个图是我建的两个不同的模型(其实差别不大)的Gaussian计算频率的结果,虽然比较明确的知道这两个模型的第一个振动模式是一样的,但是就是想通过振动模的内积来确定一下,好像是可以通过振动模式对应矩阵的内积来做,请问下大家有没有了解这个怎么去做,而且矩阵内积的话两个矩阵不应该是m*n,n*m这种形状吗,我在图中红线框出的不能做内积吧.

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